[发明专利]通过角度配置搜索的用于基因分型的系统和方法

摘要

本发明提供了用于分析基因分型数据的方法和系统。根据方法和系统的多个实施方案，可以进行角度配置搜索。在多个实施方案中，可以进行整个角度配置空间内的穷举搜索以向多个角度提供拟合，所述角度是由从多个生物样品产生的数据集中的多个点确定的。关于多个实施方案，可以定义角度配置空间以确保可以确定整体拟合。根据多种方法和系统，可以搜索可能的角度配置数据库，其中，各角度配置可以包括3个角度。根据多种方法和系统，可能的角度配置数据库可以包括：对于各角度配置的可能出现的角度配置概率。

主权项

用指令编码的、通过处理器执行的、用于测定生物样品中的基因位点的基因型的计算机可读介质，所述指令包括用于实施如下步骤的指令：接收基因分型测定的数据集，其中，所述数据集包括多个生物样品中各样品的数据点；确定所述数据集中各数据点的角度，其中，所述各角度的顶点包括定义的原点；进行数据集的最佳角度配置搜索；所述最佳角度配置搜索包括将数据集中的各数据点确定的角度与数据库中的多个角度配置中的角度配置最佳拟合；和基于所述数据集与最佳拟合的角度配置的拟合指定多个生物样品中各样品的最终基因型类别，其中，所述最佳拟合角度配置的各角度与定义基因型类别的有限的等位基因组合离散地相关。