[发明专利]基于模型的qPCR的系统和方法有效
申请号: | 201180027423.7 | 申请日: | 2011-04-11 |
公开(公告)号: | CN103038774B | 公开(公告)日: | 2017-09-22 |
发明(设计)人: | 华莱士·R·乔治 | 申请(专利权)人: | 生命技术公司 |
主分类号: | G06F19/12 | 分类号: | G06F19/12;G06F19/28;G06F17/50;C12Q1/68;G01N33/50 |
代理公司: | 北京英赛嘉华知识产权代理有限责任公司11204 | 代理人: | 王达佐,洪欣 |
地址: | 美国加利*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | 本发明提供了确定PCR扩增曲线循环阈值的方法。该方法包括接收用于PCR扩增反应的多个生物样品的数据集。数据集包括多条扩增曲线,每条扩增曲线都与多个生物样品中的一个生物样品相关。该方法还包括实施非线性优化,其包含每条扩增曲线与其互补模型化扩增曲线的拟合以确定模型化效率曲线和相关扩增曲线的最佳拟合参数集。模型化扩增曲线基于模型效率曲线。该方法包括基于模型化效率曲线与模型化扩增曲线的互补关系确定每个生物样品的循环阈值。 | ||
搜索关键词: | 基于 模型 qpcr 系统 方法 | ||
【主权项】:
确定PCR扩增曲线循环阈值的方法,所述方法包括:通过处理器接收用于PCR扩增反应的多个生物样品的数据集,其中所述数据集包括多条扩增曲线,每条扩增曲线都与所述多个生物样品中的一个生物样品相关;以及在计算机显示器上,显示每个生物样品的模型化扩增曲线和循环阈值,其中每个循环阈值是通过处理器、基于每个样品的模型化效率曲线与所述模型化扩增曲线的互补关系确定的,其中每个模型化扩增曲线是通过处理器、利用相关的模型化效率曲线逐个循环地确定和生成的。
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G06 计算;推算;计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
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