[发明专利]用于遗传成像的系统和方法在审

专利信息
申请号: 201180031402.2 申请日: 2011-05-06
公开(公告)号: CN102959552A 公开(公告)日: 2013-03-06
发明(设计)人: 赵基浩;D·G·格林哈尔希 申请(专利权)人: 施里纳斯儿童医院;加利福尼亚大学董事会
主分类号: G06F19/22 分类号: G06F19/22;G06K9/62;H03M7/30
代理公司: 中国国际贸易促进委员会专利商标事务所 11038 代理人: 袁泉
地址: 美国佛*** 国省代码: 美国;US
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摘要: 序列数据例如遗传序列数据例如核酸或氨基酸序列可以在如本文定义的遗传图像中表示,所述遗传图像提供可以电子(例如通过计算机)或光学例如视觉上或通过光学扫描设备分析的紧密的便携式图像。描述了通过其首先将序列数据转换为数字数据集的新方法和系统,所述数字数据集依次编码以形成遗传图像。遗传图像可以向回追踪,以测定原始序列数据。
搜索关键词: 用于 遗传 成像 系统 方法
【主权项】:
一种形成表示核苷酸序列的数字数据集的计算机实现的方法,所述方法包括:接受表示包含连续系列核苷酸的核苷酸序列的电子信息;获得遗传分析器的电子集合,其中每个遗传分析器包含“n”个核苷酸,其中所述集合包含在集合中的遗传分析器的“n”个位置各自上在核苷酸序列中存在的“X”个不同核苷酸的所有可能组合;其中所述集合具有已知次序的遗传分析器;其中Xn是集合中的遗传分析器数目;并且其中每个遗传分析器具有独特序列,其提供在“n”个核苷酸的每个区段内或末端上的特定位点上在核苷酸序列内的切割位点,其等同于给定遗传分析器;将具有遗传分析器的有序集合的核苷酸序列转换成包含一系列数字组的数字数据,其中对于遗传分析器集合的每个独特的遗传分析器生成一组数字,其中所述组中的每个数字包含由给定独特的遗传分析器提供的在核苷酸序列中的相继切割位点之间的核苷酸总数,并且其中数字数据集中的数字组以遗传分析器集合的已知次序组构;和生成数字数据集,其按次序包含所述核苷酸序列的5'末端的前n–1个核苷酸、所述数字数据和所述核苷酸序列的3'核苷酸。
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