[发明专利]用于预测未观察到的表型（PUP）的方法和组合物

摘要

在此提供了用于预测未观察到的表型的多种方法。在一些实施方案中，这些方法包括：(a)确定在一个基因分型的并且表型分型的参比种群中针对一种表型的多个标记的标记效应，其中该参比种群包括一个F2代、一个F3代、或一个后续代；(b)对一个预测种群的一株或多株植物针对该多个标记进行基因分型，其中该预测种群中的一株或多株植物中的每一株都是两个亲本的一个后代并且每一个亲本与被用来产生该参比种群的这两个亲本植物中的至少一个具有至少80%的遗传一致性；(c)基于步骤(b)的基因分型，针对该预测种群中的一株或多株植物中的每一株对在步骤(a)中所确定的这些标记效应进行求和；以及(d)基于来自步骤(c)的这些标记效应之和来预测在该预测种群中的一株或多株植物的一种表型。在此还提供了用于产生具有一种感兴趣的表型的植物的方法、以及用于估算在种群之间的遗传相似性的方法。

主权项

一种用于预测在一个预测种群中的植物的表型的方法，该方法包括：(a)确定在一个基因分型的并且表型分型的参比种群中针对一种表型的多个标记的标记效应，其中该参比种群包括：(i)一个F2代，该F2代是通过使两个亲本植物杂交以产生一个F1代并且然后使F1代互交、回交、和/或自交，和/或从F1形成一个双单倍体而产生的；和/或(ii)一个F3或后续代，其中该F3或后续代是通过使F2代和/或一个后续代互交、回交、自交，和/或从其中产生多个双单倍体而产生的；(b)对一个预测种群中的一株或多株植物针对该多个标记进行基因分型，其中该预测种群中的一株或多株植物中的每一个都是两个亲本的一个后代并且每一个亲本与被用来产生该参比种群的这两个亲本植物中的至少一个具有至少80%的遗传一致性；(c)基于步骤(b)的基因分型，针对该预测种群中的一株或多株植物中的每一株对在步骤(a)中所确定的这些标记效应进行求和；并且(d)基于来自步骤(c)的这些标记效应之和来预测在该预测种群中的一株或多株植物的一种表型。