[发明专利]制造用于检测靶碱基的含RNA探针的方法

摘要

公开了制造用于检测靶碱基的含RNA探针的简单而有用的方法；碱基序列信息处理方法；碱基序列信息处理装置；碱基序列信息处理系统；和用于检测碱基的方法。所公开的碱基序列信息处理方法包含这样的步骤，其中产生含有7-14个碱基和具有25-40℃的Tm值的部分碱基序列，且靶碱基或邻近靶碱基的碱基为自所述部分碱基序列3’或5’端的第3、第4、第5个碱基。当关于在未基于研究者角色的直觉或经验的情况下，简单而有效地制造用于检测靶碱基的含RNA探针时，所公开的方法是有用的。所述方法不仅在遗传工程领域而且在医学研究领域中极为有用。

主权项

用于处理核苷酸序列信息的方法，其通过用于处理所述核苷酸序列信息的装置来实施，所述方法包括以下步骤：将靶核苷酸的位置信息输入待输入的核苷酸序列中，藉此输出包含所述输入的靶核苷酸位置信息的核苷酸序列，所述待输入的核苷酸序列包含所述靶核苷酸、邻近所述靶核苷酸5’侧的核苷酸和邻近所述靶核苷酸3’侧的核苷酸；产生包含所述靶核苷酸位置信息的核苷酸序列，其与包含所述靶核苷酸位置信息的所述待输出的核苷酸序列互补；产生核苷酸序列及其互补核苷酸序列，其通过将核苷酸序列中的所述靶核苷酸或邻近所述靶核苷酸的核苷酸变换为RNA来获得，在所述核苷酸序列中包含所述靶核苷酸或邻近所述靶核苷酸的每个核苷酸的位置信息；和自通过所述RNA核苷酸变换获得的核苷酸序列及其互补核苷酸序列产生部分核苷酸序列，其包含所述靶核苷酸或邻近所述靶核苷酸的每个核苷酸的位置信息，其中(d)所述部分核苷酸序列中的核苷酸数量为7‑14，(e)所述部分核苷酸序列的Tm值为25‑40℃，和(f)所述核苷酸序列中的靶核苷酸或邻近靶核苷酸的核苷酸位于距3’或5’端3‑5个核苷酸的位置。