[发明专利]猪PPARδ基因5’调控区作为脂肪沉积性状的遗传标记

摘要

本发明属于猪分子标记制备技术领域，具体涉及一种与猪脂肪沉积性状相关的遗传标记、制备方法及应用。从猪PPARδ基因5’调控区片段克隆得到猪脂肪性状关的标记，其序列如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示，在所述序列第316碱基处有一个A/G碱基突变，导致EcoR I-RFLP多态性。主要步骤：从猪血液中提取基因组DNA，设计引物，PCR扩增，PCR产物克隆、测序，序列比较分析，SNP检测，标记与脂肪沉积性状间相关性分析，突变影响转录活性变化的试验验证等。还公开了猪PPARδ基因5’调控区的SNP分型检测技术，发现该A/G突变位点与背膘厚等脂肪沉积性状呈显著相关。

主权项

一种筛选的与猪脂肪沉积性状相关的遗传标记，其特征在于它的核苷酸序列如下所示：TCAAAGGCAAGGAGGTTAACATCTGAATGACAAAAGTAGTGTACATTCATTTCAAAAAGTAGAGAAGAAAAAAAAGAAGCAGGCATTCCTTTGCGGAGCGGTGGGTTAGGGATCCGGTGTTGTCACTGCAGCAGCCTGGGTCACTTGCTGTGGATTGGGTTCCATCCCTGGCCGGGTTGCATGCTGCAGGTGCAACCAAAAAAACCCTTCCCCAAAACCAAACCAAAACAAAAGACCATCGTTAAGAAGCAAGAATAGCGAGTCTCCCTTGTGGCTAAGTGGAAACGAACACGACTAGTATCCAGGAGGATGTGARTTTGATCCCGGCATCTCCGATTTGATCCACAGCCTGGGAACTTCGCATGCTGTACCTGCCACCCCACCCCGCCAAATCGAGGACATAATTTTCTACAACAGTATGGAGGATGTTCCCCATTTAGGCGAGCAAGCATATTAAATAAATAGGAAGACAGGTAAGAAGTCCAGAACCATACATTTCTAGTTGCAGAAGCCTCATGAGGGAGCGAAGCCCTTTTGTGAAAATTATAGGCAGCACAGTTTCCTCCAG上述序列中的R是A或G，导致EcoR I‑RFLP多态性；和TCAAAGGCAAGGAGGTTAACATCTGAATGACAAAAGTAGTGTACATTCATTTCAAAAAGTAGAGAAGAAAAAAAAGAAGCAGGCATTCCTTTGCGGAGCGGTGGGTTAGGGATCCGGTGTTGTCACTGCAGCAGCCTGGGTCACTTGCTGTGGATTGGGTTCCATCCCTGGCCGGGTTGCATGCTGCAGGTGCAACCAAAAAAACCCTTCCCCAAAACCAAACCAAAACAAAAGACCATCGTTAAGAAGCAAGAATAGCGAGTCTCCCTTGTGGCTAAGTGGAAACGAACACGACTAGTATCCAGGAGGATGTGARTTCGATCCCGGCATCTCCGATTTGATCCACAGCCTGGGAACTTCGCATGCTGTACCTGCCACCCCACCCCGCCAAATCGAGGACATAATTTTCTACAACAGTATGGAGGATGTTCCCCATTTAGGCGAGCAAGCATATTAAATAAATAGGAAGACAGGTAAGAAGTCCAGAACCATACATTTCTAGTTGCAGAAGCCTCATGAGGGAGCGAAGCCCTTTTGTGAAAATTATAGGCAGCACAGTTTCTCCAG上述序列中的R是A或G，导致EcoR I‑RFLP多态性。