[发明专利]基于细分方法的分子表面网格生成方法

摘要

本发明公开了一种基于细分方法的分子表面网格生成方法。针对SES分子表面的三种面片提出了具体的网格细分生成算法。对马鞍环面片采用扇形极限细分法；对三角凹面片和凸球面片采用基于三角形边细分的球面映射法。并使用OpenGL工具在vs2010开发环境下实现了这一算法，并借助CUDA并行技术加速网格化和显示过程。实验结果表明，该方法在分子表面构造中达到了很好的效果，且效率更高。

主权项

一种基于细分方法的分子表面网格生成方法，其操作步骤如下：①对组成分子的所有原子进行预处理，使用分子表面原子滚动算法简称MSARA算法,提取出暴露在SES分子表面的原子,即探针求probe在滚动过程中可以接触到；剔除掉被覆盖在分子内部，从外面看不到的那些内部原子；②分别对组成SES的三类面片—马鞍环面片、三角凹面片和凸球面,进行细分：对马鞍环面片采用扇形极限细分法；对三角凹面片和凸球面片采用基于三角形边细分的球面映射法，它是一种结合调和映射和球面均值的细分方法，专门对三角凹面片和凸球面进行细分；③使用OpenGL工具对细分后所得到的三维数据进行显示；④借助CUDA并行技术加速网格化和显示过程。