[发明专利]一种光滑球拟酵母基因组代谢模型的构建及应用技术

摘要

本发明阐述了一种光滑球拟酵母基因组规模代谢网络模型构建的方法及应用技术，属于系统生物学领域。该模型的构建方法是一种全面的半自动构建方法：基于自动化的模型，结合光滑球拟酵母蛋白质同源性的比较基因组学注释和菌体特异性信息。本发明提出了一种营养缺陷型特性在光滑球拟酵母代谢网络的表征方法：通过添加菌体缺失的必须营养物质到生物量方程中。在光滑球拟酵母代谢网络模型中单基因敲除乙醇脱氢酶，运用流量平衡分析，使得丙酮酸产量增加。本发明为全面理解和改造光滑球拟酵母的生理生化代谢提供了一个高效的平台。

主权项

一种光滑球拟酵母基因组规模代谢网络的构建方法，其特征在于：从一个运用自动化方法构建的光滑球拟酵母基因组代谢初模型出发，通过基于蛋白序列同源性的比较基因组学注释和菌体特异性生理生化信息补充，得到一个符合基因蛋白反应关系的可以运用COBRA工具箱分析的矩阵模型。