[发明专利]基于复杂网络模型并行化标签传播算法的药物社团发现方法有效
申请号: | 201210111171.2 | 申请日: | 2012-04-16 |
公开(公告)号: | CN102663108A | 公开(公告)日: | 2012-09-12 |
发明(设计)人: | 王崇骏;刘正;杨鸿超;孙道平;谢俊元 | 申请(专利权)人: | 南京大学 |
主分类号: | G06F17/30 | 分类号: | G06F17/30 |
代理公司: | 南京天翼专利代理有限责任公司 32112 | 代理人: | 汤志武 |
地址: | 210093 江*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | 本发明提供一种基于复杂网络模型并行化标签传播算法的药物社团发现方法,包括如下步骤:组网阶段:a)预处理生成中药数据集,格式化为文本数据;b)将初始文本数据部署至Hadoop平台;c)并行化组建中药药物(Traditional Chinese Medicine简称TCM)网络;d)结束。挖掘阶段:a)获取步骤1-c处理生成的TCM网络文本文件;b)将TCM网络文本文件部署至Hadoop平台;c)实施并行化标签传播算法发现药物社团;d)结束。本发明的基于复杂网络模型并行化标签传播算法的药物社团发现方法建立了TCM网络模型,利用并行化技术提高了组网以及标签传播算法的可扩展性和运行速度,并且能有效挖掘复方中药性相似的药物社团,帮助研究中药配伍规律。 | ||
搜索关键词: | 基于 复杂 网络 模型 并行 标签 传播 算法 药物 社团 发现 方法 | ||
【主权项】:
一种基于复杂网络模型并行化标签传播算法的药物社团发现方法,其特征在于,包括如下步骤:1)组网阶段:a预处理以生成中药数据集,格式化为初始文本数据;b将初始文本数据部署至Hadoop平台;c并行化组建中药药物网络,该网络以药物为节点,将SCAB大于给定阈值的节点连边;d结束。2)挖掘阶段:a获取步骤1)‑c处理生成的中药药物网络文本文件;b将上述中药药物网络文本文件部署至Hadoop平台;c实施并行化标签传播算法,即采用MapReduce框架并行化的标签传播算法,利用节点邻居信息迭代更新自身标签,以发现药物社团;d)结束。
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