[发明专利]利用整合工具预测水稻蛋白质磷酸化位点的方法无效
申请号: | 201210282068.4 | 申请日: | 2012-08-09 |
公开(公告)号: | CN102819690A | 公开(公告)日: | 2012-12-12 |
发明(设计)人: | 何华勤 | 申请(专利权)人: | 福建农林大学 |
主分类号: | G06F19/10 | 分类号: | G06F19/10 |
代理公司: | 福州元创专利商标代理有限公司 35100 | 代理人: | 蔡学俊 |
地址: | 350002 福*** | 国省代码: | 福建;35 |
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摘要: | 本发明涉及一种利用整合工具预测水稻蛋白质磷酸化位点的方法,其特征在于:以在试验中检测到的水稻蛋白质磷酸化位点数据为训练集,以n种蛋白质磷酸化位点预测工具为子工具,通过一定的权重策略,为各子工具分配权重,将n种子工具整合成水稻蛋白质磷酸化位点预测的整合工具,通过所述整合工具预测水稻蛋白质磷酸化位点。其中,由基于网格的随机数加权法整合而成的整合工具PhosphoRice预测性能最佳。该方法有利于提高蛋白质磷酸化位点的预测准确性。 | ||
搜索关键词: | 利用 整合 工具 预测 水稻 蛋白质 磷酸化 方法 | ||
【主权项】:
一种利用整合工具预测水稻蛋白质磷酸化位点的方法,其特征在于:以在试验中检测到的水稻蛋白质磷酸化位点数据为训练集,以n种蛋白质磷酸化位点预测工具为子工具,通过一定的权重策略,为各子工具分配权重,将n种子工具整合而成水稻蛋白质磷酸化位点预测的整合工具,通过所述整合工具预测水稻蛋白质磷酸化位点。
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G06 计算;推算;计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
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