[发明专利]一种提高植物遗传资源核心种质代表性的取样方法无效
申请号: | 201210290569.7 | 申请日: | 2012-08-15 |
公开(公告)号: | CN102890755A | 公开(公告)日: | 2013-01-23 |
发明(设计)人: | 胡晋;王建成;关亚静;朱岩芳;祝水金 | 申请(专利权)人: | 浙江大学 |
主分类号: | G06F19/24 | 分类号: | G06F19/24 |
代理公司: | 浙江杭州金通专利事务所有限公司 33100 | 代理人: | 王雪 |
地址: | 310058 浙江*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | 本发明提供一种提高植物遗传资源核心种质代表性的取样方法,包括:搜集遗传资源样品的不同性状数据,确定核心种质取样比例;将全部样品数据进行标准化;计算各个样品间的遗传距离;将全部遗传距离按从大到小的顺序进行排序,找出其中最小的遗传距离;根据最小遗传距离,找到其对应的各个样品,随机保留一个;对剩下的全部样品重新计算各个样品间的遗传距离;将遗传距离按从大到小顺序进行排序,找出其中最小的遗传距离;按照前述方法删减样品;将上述步骤反复进行,群体规模不断缩小,直至达到确定的取样比例规模,剩下的样品构成了核心种质。本发明保证核心样品的遗传多样性和核心种质的代表性。 | ||
搜索关键词: | 一种 提高 植物 遗传 资源 核心 种质 代表性 取样 方法 | ||
【主权项】:
一种提高植物遗传资源核心种质代表性的取样方法,包括以下步骤:(1)搜集遗传资源样品的不同性状数据,不同性状数据包含数量性状和质量性状,性状数据数目一般不低于5个;同时根据遗传资源群体大小和资金、空间及实际需要等条件确定核心种质取样比例;(2)将遗传资源原始群体每个数量性状的全部样品数据进行标准化,以排除不同性状量纲的影响;(3)根据标准化后的原始群体数据,计算各个样品间的遗传距离;(4)将全部遗传距离按从大到小的顺序进行排序,找出其中最小的遗传距离;(5)根据最小遗传距离,找到其对应的各个样品,随机保留一个,其余样品全部删除;(6)对剩下的全部样品重新计算各个样品间的遗传距离;(7)将步骤(6)中的遗传距离按从大到小顺序进行排序,找出其中最小的遗传距离;按照步骤(5)的方法删减样品;(8)将步骤(6)~(7)反复进行,群体规模不断缩小,直至达到步骤(1)确定的取样比例规模,剩下的样品构成了核心种质。
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G06 计算;推算;计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
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