[发明专利]基于通路模式挖掘的中药活性成分预测方法有效
| 申请号： | 201210309385.0 | 申请日： | 2012-08-28 |
| 公开（公告）号： | CN102841186A | 公开（公告）日： | 2012-12-26 |
| 发明（设计）人： | 卢朋;代文;高一波;陈琳;刘西;宋江龙;陈迪;温伟娜 | 申请（专利权）人： | 中国科学院自动化研究所 |
| 主分类号： | G01N33/15 | 分类号： | G01N33/15 |
| 代理公司： | 中科专利商标代理有限责任公司 11021 | 代理人： | 宋焰琴 |
| 地址： | 100190 *** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种基于通路模式挖掘的中药活性成分预测方法，该方法包括如下步骤：收集中药的含有CAS登记号的化合物成分数据；收集化合物的关联基因，形成化合物-基因关联对，依据关联基因的出现频率对基因进行排序，形成关联基因列表；设置阈值筛选频繁基因，形成生物通路数据集，每一个频繁基因对应一条生物通路数据记录；针对生物通路数据集挖掘通路模式；对频繁基因进行评分；对化合物活性进行评分；对基因得分和化合物活性得分设置阈值，依此对化合物-基因关联对进行筛选，保留剩下的化合物，从而预测中药的活性成分。 | ||
| 搜索关键词： | 基于 通路 模式 挖掘 中药 活性 成分 预测 方法 | ||
【主权项】：
一种基于通路模式挖掘的中药活性成分预测方法，该方法包括如下步骤：步骤1：收集中药的含有登记号的化合物成分数据；步骤2：查询第一数据库，收集化合物的关联基因，形成化合物‑基因关联对，依据所述关联基因的出现频率对基因进行排序，形成关联基因列表；步骤3：设置阈值筛选频繁基因，通过查询第二数据库，收集每一个频繁基因相关的生物通路，形成生物通路数据集；步骤4：针对所述生物通路数据集，选取算法，挖掘通路模式；步骤5：对频繁基因进行评分；步骤6：对化合物活性进行评分；步骤7：对所述基因得分和所述化合物活性得分设置阈值，对化合物‑基因关联对进行筛选，保留剩下的化合物。
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