[发明专利]检测水稻品种密阳46高硅含量等位基因qHUS6的特异性PCR分子标记

摘要

本发明提供了检测水稻品种密阳46高硅含量等位基因qHUS6的16个特异性PCR分子标记，分别为Si2925A、Si2925B、Si2926A、Si2926B、Si2927A、Si2927B、Si2927C1、Si2927C2、Si2927C3、Si2933A、Si2933B、Si2933C、Si2936、Si2939、Si2940、Si2946的PCR引物。利用这16个标记对水稻苗期所提取的DNA进行鉴定，可以检测待测材料是否转入水稻品种密阳46的高硅含量等位基因qHUS6，即是否具有提高水稻硅含量的能力，整个检测过程操作简单且准确性高。

主权项

检测水稻品种密阳46高硅含量等位基因qHUS6的特异性PCR分子标记，包含16个特异性标记Si2925A、Si2925B、Si2926A、Si2926B、Si2927A、Si2927B、Si2927C1、Si2927C2、Si2927C3、Si2933A、Si2933B、Si2933C、Si2936、Si2939、Si2940、Si2946的引物各一对：Si2925A的上游引物序列为5'‑TTGGCTAGCTTAACCTTCC‑3'，所述核苷酸序列为SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列；Si2925A的下游引物序列为5'‑GGCCATGTCAAATTAATAACCTC‑3'，所述核苷酸序列为SEQ ID NO:2所示的核苷酸序列；Si2925B的上游引物序列为5'‑CATCTGTGTCACTGTTTGGCT‑3'，所述核苷酸序列为SEQ ID NO:3所示的核苷酸序列；Si2925B的下游引物序列为5'‑GGCCATGTCAAATTAATAACCTC‑3'，所述核苷酸序列为SEQ ID NO:4所示的核苷酸序列；Si2926A的上游引物序列为5'‑TACGGATCATATCTTGGATGC‑3'，所述核苷酸序列为SEQ ID NO:5所示的核苷酸序列；Si2926A的下游引物序列为5'‑TAACATATCTGATCGGTGCCTA‑3'，所述核苷酸序列为SEQ ID NO:6所示的核苷酸序列；Si2926B的上游引物序列为5'‑TACGGATCATATCTTGGATGC‑3'，所述核苷酸序列为SEQ ID NO:7的所示核苷酸序列；Si2926B的下游引物序列为5'‑ACCAGGAATATCGGTGACCA‑3'，所述核苷酸序列为SEQ ID NO:8所示的核苷酸序列；Si2927A的上游引物序列为5'‑AGACCTGCCTAGCTGT‑3'，所述核苷酸序列为SEQ ID NO:9的所示核苷酸序列；Si2927A的下游引物序列为5'‑AAAATGTTTGGCTAGCTTATGAGA‑3'，所述核苷酸序列为SEQ ID NO:10所示的核苷酸序列；Si2927B的上游引物序列为5'‑CATGCAGGCTCTTAAGTGT‑3'，所述核苷酸序列为SEQ ID NO:11的所示核苷酸序列；Si2927B的下游引物序列为5'‑AAAATGTTTGGCTAGCTTATGAGA‑3'，所述核苷酸序列为SEQ ID NO:12所示的核苷酸序列；Si2927C1的上游引物序列为5'‑AACATGAGAAAATAACTTGCACAT‑3'，所述核苷酸序列为SEQ ID NO:13的所示核苷酸序列；Si2927C1的下游引物序列为5'‑TCATTCTGATAGCTTTGTCCC‑3'，所述核苷酸序列为SEQ ID NO:14所示的核苷酸序列；Si2927C2的上游引物序列为5'‑AACATGAGAAAATAACTTGCACAT‑3'，所述核苷酸序列为SEQ ID NO:15的所示核苷酸序列；Si2927C2的下游引物序列为5'‑CCGTCATCGCCCGTTC‑3'，所述核苷酸序列为SEQ ID NO:16所示的核苷酸序列；Si2927C3的上游引物序列为5'‑AACTTGGGACAAAGCTATCAGA‑3'，所述核苷酸序列为SEQ ID NO:17的所示核苷酸序列；Si2927C3的下游引物序列为5'‑CCGTCATCGCCCGTTC‑3'，所述核苷酸序列为SEQ ID NO:18所示的核苷酸序列；Si2933A的上游引物序列为5'‑AGACGCTCATATTCAACAC‑3'，所述核苷酸序列为SEQ ID NO:19的所示核苷酸序列；Si2933A的下游引物序列为5'‑TAAAGCGCAATCAGACT‑3'，所述核苷酸序列为SEQ ID NO:20所示的核苷酸序列；Si2933B的的上游引物序列为5'‑AGTACTACATACCCCTATCCAC‑3'，所述核苷酸序列为SEQ ID NO:21的所示核苷酸序列；Si2933B的下游引物序列为5'‑AATATATGTATAGACCACGCGCACT‑3'，所述核苷酸序列为SEQ ID NO:22所示的核苷酸序列；Si2933C的上游引物序列为5'‑GAAAATATATACTAGCAATCCTCGCAAA‑3'，所述核苷酸序列为SEQ ID NO:23的所示核苷酸序列；Si2933C的下游引物序列为5'‑CATAGGCTTGCATCCAGACTC‑3'，所述核苷酸序列为SEQ ID NO:24所示的核苷酸序列；Si2936的上游引物序列为5'‑AAACTTAAAGAAATTTGACTATGAAA‑3'，所述核苷酸序列为SEQ ID NO:25的所示核苷酸序列；Si2936的下游引物序列为5'‑AACAAGATCTGATCAACTTCAC‑3'，所述核苷酸序列为SEQ ID NO:26所示的核苷酸序列；Si2939的上游引物序列为5'‑GGTAAATTGTCTTTCCATACTATTG‑3'，所述核苷酸序列为SEQ ID NO:27的所示核苷酸序列；Si2939的下游引物序列为5'‑AATTATTTGGAGGAGCGTATC‑3'，所述核苷酸序列为SEQ ID NO:28所示的核苷酸序列；Si2940的上游引物序列为5'‑ACACTCATTTCAAGATTCAACTT‑3'，所述核苷酸序列为SEQ ID NO:29的所示核苷酸序列；Si2940的下游引物序列为5'‑GCCAATATAAACAAGGTTACTACTC‑3'，所述核苷酸序列为SEQ ID NO:30所示的核苷酸序列；Si2946的上游引物序列为5'‑ATGCCAATTGAGTTTCGTTCAC‑3'，所述核苷酸序列为SEQ ID NO:31的所示核苷酸序列；Si2946的下游引物序列为5'‑CATGACATCGACGCGAAGT‑3'，所述核苷酸序列为SEQ ID NO:32所示的核苷酸序列。