[发明专利]基于复杂度和分子指纹的药物-靶标结合预测方法有效
| 申请号： | 201210439995.2 | 申请日： | 2012-11-07 |
| 公开（公告）号： | CN102930179A | 公开（公告）日： | 2013-02-13 |
| 发明（设计）人： | 肖绚;闵建亮 | 申请（专利权）人： | 景德镇陶瓷学院 |
| 主分类号： | G06F19/10 | 分类号： | G06F19/10 |
| 代理公司： | 暂无信息 | 代理人： | 暂无信息 |
| 地址： | 333001 *** | 国省代码： | 江西;36 |
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| 摘要： | 本发明公开了基于复杂度和分子指纹的药物-靶标结合预测方法，基于复杂度和氨基酸二联体成分生成蛋白质伪氨基酸成分，结合蛋白质序列氨基酸成分将靶标蛋白质序列转换成421维空间向量；通过药物分子指纹软件将药物分子描述成一个256维空间向量；将描述蛋白质序列的421维空间向量和描述药物分子的256维空间向量组合成677维空间向量，作为药物-靶标结合描述符；采用模糊K近邻法对训练集进行训练，得出预测器最佳参数，将药物-靶标结合描述符输入预测器预测药物和靶标是否有关联，本方法不需要测出蛋白质的三维结构，只需蛋白质的一维序列加上药物分子指纹就可预测药物与蛋白质是否可结合，预测成功率高。 | ||
| 搜索关键词： | 基于 复杂度 分子 指纹 药物 靶标 结合 预测 方法 | ||
【主权项】：
一种基于复杂度和分子指纹的药物‑靶标结合预测方法，其特征在于，该预测方法包括以下步骤：步骤一，基于复杂度和二联体生成蛋白质伪氨基酸成分，结合蛋白质序列氨基酸成分将靶标蛋白质序列转换成421维空间向量；步骤二，通过药物分子指纹软件将药物分子描述成一个256维空间向量；步骤三，将描述蛋白质序列的421维空间向量和描述药物分子的256维空间向量组合成677维空间向量，作为药物‑靶标结合描述符；步骤四，采用模糊K近邻法对训练集进行训练，得出预测器最佳参数，将药物‑靶标结合描述符输入预测器预测药物和靶标是否有关联。
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