[发明专利]四物汤治疗痛经作用靶点的筛选方法无效
申请号: | 201210454991.1 | 申请日: | 2012-11-14 |
公开(公告)号: | CN103150489A | 公开(公告)日: | 2013-06-12 |
发明(设计)人: | 石铁流;方钊 | 申请(专利权)人: | 无锡力盟生物科技有限公司 |
主分类号: | G06F19/16 | 分类号: | G06F19/16 |
代理公司: | 无锡华源专利事务所(普通合伙) 32228 | 代理人: | 冯智文 |
地址: | 214000 江苏省无锡*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | 本发明涉及一种四物汤治疗痛经作用靶点的筛选方法,包括如下步骤:(1)挑选差异表达基因,(2)作用靶点预测分析,(3)通路富集分析,(4)选择步骤(3)所得富集通路中与四物汤治疗痛经作用相关的通路,并筛选出所述通路下富集的靶点,即得四物汤治疗痛经作用靶点。本发明提供了一种快速、精确的四物汤治疗辐射作用靶点的筛选方法,通过本发明可成功筛选出四物汤治疗痛经的作用靶点(靶向蛋白),有助于从分子层面解释其治疗痛经的作用机理,为治疗痛经的天然药物的开发以及其他中药确切作用靶点的筛选提供了新思路。 | ||
搜索关键词: | 四物汤 治疗 痛经 作用 筛选 方法 | ||
【主权项】:
一种四物汤治疗痛经作用靶点的筛选方法,其特征在于包括如下步骤: (1)挑选差异表达基因:从基因表达谱数据库GEO中下载编号为GSE23610的基因芯片数据,得到经高浓度四物汤处理的乳腺癌细胞MCF‑7和的经二甲基亚砜处理的乳腺癌细胞MCF‑7的表达谱数据,以前者作为试验组,后者作为对照组,挑选出二者差异表达基因; (2)作用靶点预测分析: 利用中药数据库TCMID搜集得到四物汤作用靶点,并将其与步骤(1)所得差异表达基因进行交集,得到四物汤预测作用靶点; (3)通路富集分析: 对步骤(2)所得预测作用靶点进行通路富集分析; (4)选择步骤(3)所得富集通路中与四物汤治疗痛经作用相关的通路,并筛选出所述通路下富集的靶点,即得四物汤抗辐射作用靶点。
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G06 计算;推算;计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
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