[发明专利]基于多核CPU和GPGPU硬件的高通量测序数据质量控制系统有效

专利信息
申请号: 201210478392.3 申请日: 2012-11-22
公开(公告)号: CN103838985A 公开(公告)日: 2014-06-04
发明(设计)人: 周茜;宁康;苏晓泉;徐健 申请(专利权)人: 中国科学院青岛生物能源与过程研究所
主分类号: G06F19/20 分类号: G06F19/20
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 266101 山*** 国省代码: 山东;37
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摘要: “基于多核CPU和GPGPU硬件的高通量测序数据质量控制系统”是针对传统计算机无法满足对海量高通量测序数据进行质量控制的分析要求,根据高通量测序数据处理中海量数据可并行处理的特点,提出一种基于多核CPU和GPGPU(通用并行处理器)硬件的、软硬件方法相结合的计算分析系统。基于多核CPU和GPGPU硬件的高通量测序数据质量控制系统的主要模块包括:多核CPU和GPGPU计算机以及统一的软件平台。其特点是(1)高性能并行计算和存储硬件系统,(2)高性能、统一的、可配置的软件平台。基于多核CPU和GPGPU硬件的高通量测序数据质量控制处理可以显著提高高通量测序数据质量控制的分析效率。
搜索关键词: 基于 多核 cpu gpgpu 硬件 通量 序数 质量 控制系统
【主权项】:
一种软硬件结合的计算机高通量测序数据质量控制系统,其特征是:系统包含计算机硬件和基于其上的软件系统,输入是在任何存储介质上保留的高通量测序数据文件,输出去除低质量序列和污染序列的定性及定量信息。
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