[发明专利]一种ROS1融合基因的筛查方法有效
申请号: | 201210507409.3 | 申请日: | 2012-11-30 |
公开(公告)号: | CN103352070A | 公开(公告)日: | 2013-10-16 |
发明(设计)人: | 陈海泉;孙艺华;王瑞;潘云建;胡海川;王磊;叶挺;罗晓阳;李航;张扬 | 申请(专利权)人: | 复旦大学附属肿瘤医院 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 上海元一成知识产权代理事务所(普通合伙) 31268 | 代理人: | 吴桂琴 |
地址: | 200032 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | 本发明属于医药和生物技术领域,涉及ROS1融合基因的筛查方法,尤其是ROS1融合基因筛查的多片段引物及其应用。本发明的ROS1融合基因筛查方法,以样本中的总RNA反转的cDNA为模板,加入核苷酸编码序列如SEQ ID NO 1-22所示的real-time PCR联合引物,进行实时荧光聚合酶链反应,并通过检测反应产物中反应单位间Ct值的差值检验是否具有ROS1融合基因突变。本发明方法具有操作简捷,节约时间,结果判断直观、明确,成本较低,污染减少的特点。 | ||
搜索关键词: | 一种 ros1 融合 基因 方法 | ||
【主权项】:
一种ROS1融合基因突变的筛查方法,其特征在于,其包括如下步骤:(1)设计筛查ROS1融合基因的11对real‑time PCR联合引物对或探针;(2)提取样本中的总RNA;(3)以样本中的总RNA为模板,通过逆转录方法合成cDNA;(4)在11个real‑time PCR反应单位中,以(3)中所得的cDNA为模板,分别加入(1)中设计的11对引物或探针,以及包括荧光染料在内的反应预混液;(5)在real‑time PCR反应仪上进行real‑time PCR反应,并分别记录每个样本的10个反应单位的荧光阈值;(6)分别计算引物或探针I~IV所在反应体系的荧光阈值的均值CtABP,和引物或探针VI~XI所在反应体系的荧光阈值的均值CtBBP;(7)计算ABP与BBP之差的绝对数,判定样本是否具有ROS1融合基因突变。
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