[发明专利]合成的丙型肝炎基因组和制备及使用方法有效
申请号: | 201280032765.2 | 申请日: | 2012-05-02 |
公开(公告)号: | CN103649316B | 公开(公告)日: | 2017-07-28 |
发明(设计)人: | 斯图尔特·坎贝尔·雷;苏普里娅·穆恩肖;林·刘 | 申请(专利权)人: | 约翰霍普金斯大学 |
主分类号: | C12N15/33 | 分类号: | C12N15/33;C12N5/10;C12N15/11;C12Q1/68;G01N33/569;A61K39/12 |
代理公司: | 北京安信方达知识产权代理有限公司11262 | 代理人: | 李平,郑霞 |
地址: | 美国马*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | 使用Bayesian系统发生树分析、祖先序列重建和协方差分析的本发明的方法提供了包括被称为Bole1a和Bole1b的1a和1b基因组的合成的代表性的HCV亚型。Bole1a集中分支在用于其设计的390条全基因组序列、谨慎组织的143条序列全基因组数据集和包括来自Baltimore定群的214条E1E2序列的独立的组的单独的基因组区中。Bole1a是广泛流行的毒株的系统发生代表。全基因组非同义多样性比较和9‑mer肽覆盖分析显示Bole1a能够比包括传统的参考序列H77的数据集中任何其他序列提供更多的覆盖(分别地94%和78%)。当与所有已知的T细胞表位相比时,Bole1a还提供了无与伦比的表位覆盖。 | ||
搜索关键词: | 合成 肝炎 基因组 制备 使用方法 | ||
【主权项】:
一种核酸分子,其编码合成的丙型肝炎病毒亚型1a的基因组(Bole1a),所述核酸分子的核苷酸序列是SEQ ID NO:1或其互补序列。
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