[发明专利]根据具有多个供体的DNA样本来识别供体的STR的系统和方法无效
申请号: | 201280037245.0 | 申请日: | 2012-06-21 |
公开(公告)号: | CN103917662A | 公开(公告)日: | 2014-07-09 |
发明(设计)人: | B·拉森;R·施赖纳;C·T·刘易斯 | 申请(专利权)人: | 沃数据系统公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;G06F19/22 |
代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 赵蓉民;张全信 |
地址: | 美国加利*** | 国省代码: | 美国;US |
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摘要: | 在本发明的一方面下,提供分析来自两个或更多个供体的DNA的混合物以识别在多个STR基因座处至少一个供体的STR基因型的方法。对于各STR基因座,可独立地确定可能的解决方案,各解决方案包括供体的数目、在该基因座处各供体的STR基因型、他们各自成分的丰度比、和置信度得分。然后将具有最高置信度得分的STR基因座的最可能解决方案用作已知条件,根据其可连续获得其他STR基因座的解决方案,在各情况下,使用任何之前分析的基因座的最可能解决方案作为已知条件。输出在最后分析的STR基因座的最可能的解决方案中使用的供体的数目和丰度比共享作为已知条件的STR基因型。 | ||
搜索关键词: | 根据 具有 供体 dna 样本 识别 str 系统 方法 | ||
【主权项】:
一种分析来自两个或更多个供体的DNA的混合物以识别在多个STR基因座处所述供体至少之一的STR基因型的方法,所述方法包括:(a)对于在所述多个STR基因座中的各STR基因座,鉴于表征在该基因座处在所述混合物中STR的相对丰度和尺寸的数据,独立地确定所述STR基因座的多个可能的解决方案和可能的解决方案的各置信度得分,各解决方案包括:(i)供体的限定数目N,(ii)在该基因座处N个供体各自限定的STR基因型,以及(iii)来自所述N个供体的各自成分的限定丰度比;(b)对于具有最高置信度得分的STR基因座,选择具有阈值以上的似然性的该基因座的一个或多个可能的解决方案;(c)对于具有下一最高置信度得分的STR基因座,通过以下步骤分析该基因座:(i)鉴于数据和鉴于所述具有最高置信度得分的STR基因座的选择的一个或多个解决方案的所述限定数目N和所述限定丰度比,确定所述STR基因座的多个可能的解决方案,以及通过(ii)选择具有阈值以上似然性的该基因座的一个或多个解决方案;(d)鉴于上一分析的STR基因座的可能的解决方案的所述限定数目N和所述限定丰度比,以置信度得分下降顺序对剩余的各STR基因座连续重复步骤(c);以及(e)输出分析的最后分析的STR基因座的最可能的选择的解决方案的STR基因型以及共享用于确定所述最后分析的STR基因座的所述最可能的选择的解决方案的所述限定数目N和所述限定丰度比作为已知条件的各之前分析的STR基因座的各选择的解决方案的STR基因型。
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