[发明专利]通过质谱术和分数规整识别微生物的方法有效

专利信息
申请号: 201280058681.6 申请日: 2012-11-30
公开(公告)号: CN104040561B 公开(公告)日: 2018-06-05
发明(设计)人: 格里高利·施特鲁贝尔;莫德·阿尔萨克;丹尼斯·戴瑟利;皮埃尔-吉恩·科特-帕塔特;皮埃尔·马希 申请(专利权)人: 生物梅里埃有限公司
主分类号: G06K9/00 分类号: G06K9/00;G06K9/62
代理公司: 北京安信方达知识产权代理有限公司 11262 代理人: 周靖;郑霞
地址: 美国北卡*** 国省代码: 美国;US
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摘要: 发明涉及通过微生物的质谱从由一组参考数据表示的参考微生物中识别微生物,所述识别包括:根据质谱确定微生物的一组数据;对于每种参考微生物,计算所确定的一组数据和参考的一组数据之间的距离,根据关系式计算概率f(m):其中:m为针对参考微生物计算的距离;N(m|μ,σ)是针对m,当微生物是参考微生物时,模拟待识别的微生物和参考微生物之间的距离的随机变量的值;是针对m,当微生物不是参考微生物时,模拟待识别的微生物和参考微生物之间的距离的随机变量的值;及p是在0到1的范围内的标量。
搜索关键词: 参考微生物 微生物 组数据 质谱 随机变量 关系式计算 参考数据 规整 标量 参考 概率
【主权项】:
一种识别方法,用于通过质谱术从一组预定的参考微生物中识别微生物,每一种参考微生物由一组参考数据表示,所述方法包括:根据待识别的微生物的质谱测量结果,确定表示所述微生物的一组数据;及对于每种参考微生物,计算所确定的一组数据和所述参考微生物的所述一组参考数据之间的距离,所述方法特征在于该方法包括:根据以下关系式计算所述待识别的微生物为所述参考微生物的概率:<mrow><mi>f</mi><mrow><mo>(</mo><mi>m</mi><mo>)</mo></mrow><mo>=</mo><mfrac><mrow><msub><mi>pN</mi><mn>1</mn></msub></mrow><mrow><msub><mi>pN</mi><mn>1</mn></msub><mo>+</mo><mrow><mo>(</mo><mn>1</mn><mo>-</mo><mi>p</mi><mo>)</mo></mrow><msub><mi>N</mi><mn>2</mn></msub></mrow></mfrac></mrow>其中:m为针对所述参考微生物计算的距离;f(m)是针对所述距离m计算的概率;N1是对于距离m,当待识别的微生物是所述参考微生物时,模拟与所述待识别的微生物相关的一组数据和所述参考微生物的一组参考数据之间的距离的随机变量的值;N2是对于距离m,当待识别的微生物不是所述参考微生物时,模拟与所述待识别的微生物相关的一组数据和所述参考微生物的一组参考数据之间的距离的随机变量的值;及p是在0到1的范围内的预定的标量。
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