[发明专利]确定异常状态相关生物标志物的方法及系统有效
| 申请号： | 201280075072.1 | 申请日： | 2012-08-22 |
| 公开（公告）号： | CN104603283B | 公开（公告）日： | 2017-09-19 |
| 发明（设计）人： | 李胜辉;冯强;覃俊杰;朱剑锋;张东亚;揭著业;王俊;汪建;杨焕明 | 申请（专利权）人： | 深圳华大基因研究院;深圳华大基因科技有限公司 |
| 主分类号： | C12Q1/68 | 分类号： | C12Q1/68;C12M1/00 |
| 代理公司： | 北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙)11201 | 代理人： | 李志东 |
| 地址： | 518083 广东*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | 本发明提出了确定对象中异常状态相关生物标记物的方法和系统，包括对来自第一对象的核酸样本和来自第二对象的核酸样本进行核酸测序，以便获得分别由第一测序结果和第二测序结果构成的多个测序序列，其中，所述第一对象具有所述异常状态，所述第二对象不具有所述异常状态，所述来自第一对象的核酸样本和所述来自第二对象的核酸样本都是分离自相同类型的样本，所述第一对象和所述第二对象属于相同物种；以及基于所述第一测序结果和所述第二测序结果的差异，确定所述异常状态相关生物标志物。 | ||
| 搜索关键词： | 确定 异常 状态 相关 生物 标志 方法 系统 | ||
【主权项】：
一种确定对象中异常状态生物相关标志物的方法，包括：对来自第一对象的核酸样本和来自第二对象的核酸样本进行核酸测序，以便获得分别由第一测序结果和第二测序结果构成的多个测序序列，其中，所述第一对象具有所述异常状态，所述第二对象不具有所述异常状态，所述来自第一对象的核酸样本和所述来自第二对象的核酸样本都是分离自相同类型的样本，所述第一对象和所述第二对象属于相同物种；以及基于所述第一测序结果和所述第二测序结果的差异，确定所述异常状态相关生物标志物；所述基于所述第一测序结果和所述第二测序结果的差异，确定所述异常状态相关生物标志物进一步包括：将所述第一测序结果和所述第二测序结果与参考基因集进行比对；基于比对结果，分别确定来自所述第一对象和所述第二对象的所述核酸样本中基因的相对丰度；以及对来自所述第一对象和所述第二对象的所述核酸样本中基因的相对丰度进行统计检验；以及确定在来自所述第一对象和所述第二对象的所述核酸样本之间相对丰度存在显著差异的基因为基因标志物，对所述基因标志物进行聚类分析，获得宏基因组连锁群，作为物种标志物。
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