[发明专利]一种BWT实现方法中对后缀进行排序的方法及系统

摘要

本发明提供一种BWT实现方法中对后缀进行排序的方法及系统，通过对需要排序的后缀通过双向搜索，获得后缀位置，对所述后缀进行排序并进行信息更新的方式，通过在变换时间和资源消耗上的平衡，解决了原始BWT变换方法消耗资源大、压缩率低的问题。本发明能实现数据压缩速度快、简单，且使用资源比较合理，能节省大量资源。

主权项

一种BWT实现方法中对后缀进行排序的方法，其特征在于，包括：步骤1，从BWT的待变换序列中取出需要排序的后缀；步骤2，判断以所述后缀的开头元素的,作为断首元素的段在后缀链表中是否出现过，所述后缀的开头元素的ASC Ⅱ值为i，如果寄存器appear[i]=1，则出现过，执行步骤3；如果寄存器appear[i]＝1，则未出现过，执行步骤4，其中appear[i]代表以ASC Ⅱ表中数字i代表的元素为段首元素的段是否已经出现过的标识；步骤3，在段内进行双向搜索，获得所述后缀在所述后缀链表中的位置，然后执行步骤5；步骤4，在所述后缀表中进行双向搜索，搜索到离所述后缀最近的在所述后缀链表中存在的段，根据所述段获得所述后缀在所述后缀链表中的位置，其中所述段是以相同元素开头的后缀按从小到大顺序组成的序列，然后执行步骤5；步骤5，将所述后缀插入后缀链表：将所述后缀的段的高地址上所有后缀右移一位，将所述高地址所在的位置空出，然后在所述高地址后缀所在的位置上插入所述后缀，然后执行步骤6；步骤6，更新所述后缀链表以及段的信息，其中所述后缀链表由后缀段组成，并按照段首元素从小到大顺序排列的，所述段首元素是每个段里面后缀的开头元素。