[发明专利]斧文蛤EST序列来源微卫星特异引物及其应用

摘要

本发明涉及一种斧文蛤EST序列来源微卫星特异引物及其应用，包括：（1）斧文蛤基因组DNA的提取（２）根据cDNA数据库中斧文蛤的EST序列，获得含有SSR重复的基因序列；（３）SSR标记引物设计；（４）斧文蛤不同地理居群DNA的PCR扩增及扩增产物的变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测；（5）获得斧文蛤EST序列区呈现高度遗传变异的多态图谱，对图谱分析可得到斧文蛤每个个体EST-SSR的基因型。本发明的检测方法具有快速、方便、准确等优点，能够直观的检测出斧文蛤不同个体的基因型。本发明可应用于斧文蛤群体遗传变异分析、种质资源保护与管理、系谱认证及遗传连锁图谱构建等领域。

主权项

一种斧文蛤EST序列来源微卫星特异引物，其特征在于包括有：FW‑134：F：ACTACTAGGAACTTGCAT；R：GACAGTTTGGTTAAGAAT；退火温度为45℃，核心重复序列为(ATG)8；FW‑390：F: GCCATAGTAGTCAGAGGG ；R: AGAGATTATAGTGAACAAAGC；退火温度为48℃，核心重复序列为(CATT)6；FW‑496：F：TTGATCTAGGCAGTCGTT；R：GGCACTTCGTGTAAACAT；退火温度为46℃，核心重复序列为(TG)17；FW‑599：F：CTCAATGAATCGGACTGG；R：ATGAAAACTGGATGTCGC；退火温度为46℃，核心重复序列为(AATTG)5FW‑808：F：TTTTACCTTTCCCGAATA；R：GATGTTACGATGCCACTT；退火温度为45℃，核心重复序列为(AT)6FW‑832：F: CTGCCACAGAATCATAGA；R: CTTCAAATCAGCAACTCA；退火温度为45℃，核心重复序列为(AT)8 。