[发明专利]一种通过基因组表达谱检测药物不良反应的方法有效
申请号: | 201310045029.7 | 申请日: | 2013-02-05 |
公开(公告)号: | CN103150467A | 公开(公告)日: | 2013-06-12 |
发明(设计)人: | 王可鉴;杨仑;贺林 | 申请(专利权)人: | 上海交通大学 |
主分类号: | G06F19/00 | 分类号: | G06F19/00;G06F19/10 |
代理公司: | 上海新天专利代理有限公司 31213 | 代理人: | 张泽纯 |
地址: | 200240 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | 本发明涉及一种通过基因组表达谱检测药物不良反应的方法,包括:查询确认已知能够引起特定不良反应的药物,即风险药物;统计风险药物引起不良反应的发生频率;使用风险药物和目标药物分别处理人类或动物细胞系,并通过基因组表达芯片技术平台获得细胞系的全基因组表达谱;计算目标药物与各风险药物在基因组表达谱上的相似度,并根据风险药物的不良反应相对发生频率对表达谱相似度进行加权计算,从而对目标药物引起不良反应的风险进行打分判断。本发明的检测方法可通用于所有药物品种,不受药物种类的限制;该检测方法简单易操作,在不以实际人身伤害为代价的前提下,间接预计目标药物的不良反应风险,对临床药物风险评估有着良好的应用前景。 | ||
搜索关键词: | 一种 通过 基因组 表达 检测 药物 不良反应 方法 | ||
【主权项】:
一种通过基因组表达谱检测药物不良反应的方法,包括如下步骤:(1)查询确认已知能够引起特定不良反应的药物,即风险药物;(2)统计风险药物引起不良反应的发生频率;(3)使用风险药物和目标药物分别处理人类或动物细胞系,并通过基因组表达芯片技术平台获得细胞系的全基因组表达谱;(4)计算目标药物与各风险药物在基因组表达谱上的相似度,并根据风险药物的不良反应相对发生频率对表达谱相似度进行加权计算;(5)将目标药物与各风险药物的加权计算结果进行求和计算,从而得到目标药物引起不良反应的风险系数;(6)根据目标药物的风险系数,判断该系数高于50%以上已知的风险药物,则可视为具有潜在的安全风险。
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G06 计算;推算;计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
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