[发明专利]一种单核苷酸多态性熔解曲线分析方法有效

专利信息
申请号: 201310062601.0 申请日: 2013-02-27
公开(公告)号: CN104004823A 公开(公告)日: 2014-08-27
发明(设计)人: 郭安亮;姚见儿;刘榴 申请(专利权)人: 上海透景生命科技有限公司
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68
代理公司: 上海专利商标事务所有限公司 31100 代理人: 陈静
地址: 201203 上海市浦东新*** 国省代码: 上海;31
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摘要: 发明涉及一种单核苷酸多态性熔解曲线分析方法。本发明的方法基于等位基因特异性扩增法,针对已知SNP检测位点,设计两条特异性引物,其中一条特异性引物设计时加入一段无关序列,从而增加两种不同PCR产物的Tm值的区分度,在一个体系中检测已知SNP突变,明确区分野生型,杂合型和突变型,为临床检测提供一种结果稳定,重复性好,适用机型更广的SNP分析方法。
搜索关键词: 一种 核苷酸 多态性 熔解 曲线 分析 方法
【主权项】:
一种基于等位基因特异性扩增的SNP检测方法,其特征在于,包括如下步骤:(1)以待测基因为模板,以针对SNP位点的特异性引物以及与特异性引物配对的公用引物为引物对,以Taq DNA聚合酶进行PCR扩增;其中,所述的针对SNP位点的特异性引物包括针对野生型等位基因位点的引物1;针对突变型等位基因位点的引物2,所述引物1和引物2具有如下序列:A‑B‑C;其中,A为与模板匹配的序列片段,B为针对SNP位点的碱基;B在引物1和引物2中不同,在一条引物中B与野生型SNP位点碱基匹配,在另一引物中B与突变型SNP位点碱基匹配;C为无或为1‑2个碱基的与模板匹配的序列片段;且,引物1或引物2中一条引物的5’端还包括5‑20个碱基的与野生型及突变型模板均不匹配的无关序列,使得引物1与引物2对应的特异性PCR产物Tm值差异大于2℃;所述的公用引物是远离SNP位点的引物,其与引物1或引物2构成引物对;(2)分析PCR扩增产物,确定待测样品中待测基因的SNP类型。
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