[发明专利]一种单核苷酸多态性熔解曲线分析方法有效
申请号: | 201310062601.0 | 申请日: | 2013-02-27 |
公开(公告)号: | CN104004823A | 公开(公告)日: | 2014-08-27 |
发明(设计)人: | 郭安亮;姚见儿;刘榴 | 申请(专利权)人: | 上海透景生命科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 上海专利商标事务所有限公司 31100 | 代理人: | 陈静 |
地址: | 201203 上海市浦东新*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | 本发明涉及一种单核苷酸多态性熔解曲线分析方法。本发明的方法基于等位基因特异性扩增法,针对已知SNP检测位点,设计两条特异性引物,其中一条特异性引物设计时加入一段无关序列,从而增加两种不同PCR产物的Tm值的区分度,在一个体系中检测已知SNP突变,明确区分野生型,杂合型和突变型,为临床检测提供一种结果稳定,重复性好,适用机型更广的SNP分析方法。 | ||
搜索关键词: | 一种 核苷酸 多态性 熔解 曲线 分析 方法 | ||
【主权项】:
一种基于等位基因特异性扩增的SNP检测方法,其特征在于,包括如下步骤:(1)以待测基因为模板,以针对SNP位点的特异性引物以及与特异性引物配对的公用引物为引物对,以Taq DNA聚合酶进行PCR扩增;其中,所述的针对SNP位点的特异性引物包括针对野生型等位基因位点的引物1;针对突变型等位基因位点的引物2,所述引物1和引物2具有如下序列:A‑B‑C;其中,A为与模板匹配的序列片段,B为针对SNP位点的碱基;B在引物1和引物2中不同,在一条引物中B与野生型SNP位点碱基匹配,在另一引物中B与突变型SNP位点碱基匹配;C为无或为1‑2个碱基的与模板匹配的序列片段;且,引物1或引物2中一条引物的5’端还包括5‑20个碱基的与野生型及突变型模板均不匹配的无关序列,使得引物1与引物2对应的特异性PCR产物Tm值差异大于2℃;所述的公用引物是远离SNP位点的引物,其与引物1或引物2构成引物对;(2)分析PCR扩增产物,确定待测样品中待测基因的SNP类型。
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