[发明专利]用于同时检测牛传染性鼻气管炎病毒和赤羽病毒的多重PCR引物及其设计方法有效

专利信息
申请号: 201310071885.X 申请日: 2013-03-06
公开(公告)号: CN103160615A 公开(公告)日: 2013-06-19
发明(设计)人: 孔繁德;徐淑菲;陈圣军;张吉红;唐泰山;陈信忠;龚艳清;郭书林;杨俊萍 申请(专利权)人: 厦门出入境检验检疫局检验检疫技术中心
主分类号: C12Q1/70 分类号: C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/11;C12N15/10;C12R1/93
代理公司: 厦门南强之路专利事务所 35200 代理人: 马应森
地址: 361026 福建*** 国省代码: 福建;35
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摘要: 用于同时检测牛传染性鼻气管炎病毒和赤羽病毒的多重PCR引物及其设计方法,涉及牛传染性鼻气管炎病毒和赤羽病毒的检测。多重PCR引物中的牛传染性鼻气管炎病毒引物对应的PCR扩增片段大小为311bp,赤羽病毒引物对应的PCR扩增片段大小为392bp。1)设计多重PCR引物组合;2)对引物组合中的引物进行筛选,保留不能合成引物二聚体的引物;3)判断所保留引物的竞争优劣状态,将所保留引物的GC%和碱基数进行比较,选取GC含量高的判断为竞争状态优势引物,进行步骤5);否则进行步骤4);4)再次筛选竞争状态劣的引物,具体为重复步骤2),对所保留的引物按步骤3)再次判断;5)对竞争状态优引物进行扩增。
搜索关键词: 用于 同时 检测 传染性 气管炎 病毒 多重 pcr 引物 及其 设计 方法
【主权项】:
用于同时检测牛传染性鼻气管炎病毒和赤羽病毒的多重PCR引物,其特征在于其中,牛传染性鼻气管炎病毒引物对应的PCR扩增片段大小为311bp,赤羽病毒引物对应的PCR扩增片段大小为392bp,具体引物序列如下:IBRV F1:‑TGACGGTAGCCTGGGACTGG‑3’IBRV R1:5’‑CCGGAAGGCCACGACAAA‑3’AKAV F1:5’‑AGGGTATGTGGCATTTATCA‑3’AKAV R1:5’‑CCAGAAACATCTCAGCACC‑3’其中,IBRV为牛传染性鼻气管炎病毒的英文缩写,AKAV为赤羽病毒的英文缩写;IBRV F1和IBRV R1为根据牛传染性鼻气管炎病毒gB基因设计的上游引物F1和下游引物R1;AKAV F1和AKAV R1为根据赤羽病毒S基因设计的上游引物F1和下游引物R1。
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