[发明专利]一种G蛋白偶联受体家族的分层分类方法无效
| 申请号： | 201310176146.7 | 申请日： | 2013-05-13 |
| 公开（公告）号： | CN103258146A | 公开（公告）日： | 2013-08-21 |
| 发明（设计）人： | 贺佳;高青斌 | 申请（专利权）人： | 中国人民解放军第二军医大学 |
| 主分类号： | G06F19/24 | 分类号： | G06F19/24;G06F19/28 |
| 代理公司： | 上海泰能知识产权代理事务所 31233 | 代理人： | 黄志达 |
| 地址： | 200433 *** | 国省代码： | 上海;31 |
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| 摘要： | 本发明涉及一种G蛋白偶联受体家族的分层分类方法，包括：（1）获取G蛋白偶联受体序列数据及相应的球蛋白数据，对数据集进行去冗余处理，采用二肽组成表示G蛋白偶联受体，采用最近邻算法构建分类器，建立7水平分层分类模型；（2）对待识别G蛋白偶联受体进行识别和分类。本发明能够方便、快捷地对G蛋白偶联受体进行识别和分类，具有较高的预测准确率，性能稳定可靠；本发明适合于大规模识别生物蛋白质组中的G蛋白偶联受体，并能将G蛋白偶联受体分配至具体的亚型，在G蛋白偶联受体的功能分类研究中具有很好的应用前景。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 蛋白 受体 家族 分层 分类 方法 | ||
【主权项】：
一种G蛋白偶联受体家族的分层分类方法，包括：（1）获取G蛋白偶联受体序列数据及相应的球蛋白数据，对数据集进行去冗余处理，采用二肽组成表示G蛋白偶联受体，采用最近邻算法构建分类器，建立7水平分层分类模型；（2）对每条待识别的蛋白序列进行判别分析，若待识别蛋白被判别为球蛋白，则分类过程结束；若判别为G蛋白偶联受体，则自动进入下一层，进行功能家族分类；若待识别蛋白被判别为味觉受体家族，则分类过程结束；若判别为其他家族，则进行子家族分类；完成子家族分类之后，进一步细分至具体类型；最终根据训练样本将待识别蛋白分至具体亚型。
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G06 计算；推算；计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学，即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真，例如：概率模型或动态模型，遗传基因管理网络，蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的，例如：进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的，例如：结构排序，结构或功能关系，蛋白质折叠，结构域拓扑，用结构数据的药靶，涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的，例如：基因型–表型关联，不均衡连接，种群遗传学，结合位置鉴定，变异发生，基因型或染色体组的注释，蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
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