[发明专利]一种用于检测BCR/ABL融合基因不含重复序列的FISH探针、试剂盒及其检测方法

摘要

本发明属于生物技术领域，公开了一种用于检测BCR/ABL基因不含重复序列的FISH探针、试剂盒及其检测方法。以BCR基因和ABL基因为模板，对BCR基因和ABL基因中的非重复序列进行聚合酶连反应，扩增产物为350～800碱基对大小不等的DNA片段，消除BCR基因和ABL基因中的重复序列，从而形成不含重复序列的产物，产物经过荧光标记后获得BCR基因和ABL基因不含重复序列荧光原位杂交探针，用于BCR/ABL融合基因荧光原位杂交检测。本发明获得的BCR/ABL融合基因FISH探针可消除重复序列，显著降低FISH探针的非特异性背景信号，提高荧光原位杂交探针的特异性。

主权项

一种用于检测BCR/ABL融合基因不含重复序列的FISH探针，其特征在于，所述FISH探针DNA以BCR基因和ABL基因为模板，利用42对PCR引物组或与引物组具有同一性的核苷酸序列，进行PCR扩增反应制备得到，所述42对PCR引物组中1‑20对为BCR基因引物组，21‑42对为ABL基因引物组，所述42对PCR引物组为：1F： 5'  TCTCCCTCGCAGAACTCGC  3'1R： 5'  CAAACCACCTCCCATCCCT  3'2F： 5'  GTGCCTGTCAACTTTCTTCC  3'2R： 5'  ATCTGCCCACTCTGTCTCC  3'3F： 5'  AGCAATCAGCACATTCATAGACC  3'3R： 5'  AGAACCTGCACAACAGACCAC  3'4F： 5'  AAGCAACCTACAGGCAACA  3'4R： 5'  TGAGCCCTCCACCTAAAA  3'5F： 5'  AGTTCCTGCTTGGCTTTCA  3'5R： 5'  TTCAGCTTCATCATTTACGG  3'6F： 5'  GGAGACCGCCAAGTATTTTCA  3'6R： 5'  GTCATCCCATCATTAGACAGCA  3'7F： 5'  TGTCCGTTGGTTTGTTTTCTC  3'7R： 5'  CCATAGCTGCTGTGCCTGA  3'8F： 5'  TCGGGACAGGCACAAACC  3'8R： 5'  CCAAAGCGGAAAGAACTCG  3'9F： 5'  CCCTTCCCTAACCCACCG  3'9R： 5'  ACACCGCTTCCTCCCTGA  3'10F：5'  GCAGTTCCTGGAGCATTGAG  3'10R：5'  GGCCATTCCCTGACACCT  3'11F：5'  CCAGGACCCCGTGTAGGA  3'11R：5'  TGGGCAGACTTGGCGTATT  3'12F：5'  CACCTCAGCCCACCCAGTA  3'12R：5'  TTCCATTTCCCGAGCATC  3'13F： 5'  AGGCGAGAACAGGGCAACG  3'13R： 5'  TTCCTTCAAGAACTCCACGAT  3'14F： 5'  TACCCGAGGTCGTTGTGAGA  3'14R： 5'  GGGAGCAAGAAGGCTATGAAG  3'15F： 5'  CCTTCCTGCCTGTGCTGTT  3'15R： 5'  TCCTAGTGTTGGCTGCGTTT  3'16F： 5'  TTCACCAACTGCGACCTGC  3'16R： 5'  GCCGTCCCTGTCACAAAAG  3'17F： 5'  ATGACGGTGAAGAAGGGAGA  3'17R： 5'  CCGGAGGAAGACGTGAAGTG  3'18F： 5'  GAGGCTCCCCGAGAAGAA  3'18R： 5'  CCCAATCCCCACAACAGG  3'19F： 5'  GCTGAGCCAAACTGGAACG  3'19R： 5'  AACCCAACACCCCGAGAC  3'20F： 5'  CTTGGATGGATGTTGATGCC  3'20R： 5'  GCCCGAGTCTCAGATTTTGG  3'21 F：5'  CTTGTGGAGATGCAGCGAATGTG  3'21 R：5'  GGCAAGAAATAAGCAACTCAAAT  3'22 F：5'  AATTGATGACAGCCCAACCTG  3'22 R：5'  GAATTTTCTTAGTCAAGCCACTG  3'23 F：5'  AGTGTCGCTAGGTGAATTGTTAT  3'23 R：5'  AATCTGGGAGTTGTTTGTTTTG  3'24 F：5'  GCAAGATAAGAACAACGTACTG  3'24 R：5'  GTAAGGGCATTGACCTGGAT  3'25 F：5'  CATGACCCGAAGTATGAAATAG  3'25 R：5'  GGGAGGTTAGCAAGGAAATG  3'26 F：5'  GCAGTTGACTTTGGGAGGCT  3'26 R：5'  GGAGGAGGGCTTGAAGGATT  3'27 F：5'  TAACGTAGAGGCACAATTAGACC  3'27 R：5'  TCACAAGCTCCTGAGCAGCAGTT  3'28 F：5'  AAATGCTTCCTGGTAACTGCC  3'28 R：5'  TCTCCTCCTCTTCTCCCACC  3'29 F：5'  AATGAGTAGAGGAATCAAGGAACC  3'29 R：5'  CCCCTGCTCACAGTCTACAAAG  3'30 F：5'  TTTGGATAGTGCTCACCTCGT  3'30 R：5'  CATTTTCAGTTTCATTAGGGTCT  3'31 F：5'  TTAGTGGCTGCATTTCTCAAC  3'31 R：5'  TTCATAATATCAGGGCATCCTT  3'32 F：5'  TCTTTGTTATTCATAGTTTCCTGG  3'32 R：5'  CAGCCTTATGTATTCCGTTTTC  3'33 F：5'  GACATGCCAACTCAAACCAC  3'33 R：5'  TGGTATTATAGTGAGCTTCCAC  3'34 F：5'  AACTGTACTGCCCATAAGATGC  3'34 R：5'  TGATGAGACAAAGGATTAGAAATG  3'35 F：5'  GCTGGACAATGTTTGCTGAAT  3'35 R：5'  TGTTTTGGAAGAGGGAAGAGTT  3'36 F：5'  CAGCCAATCCCACCCATAGTT  3'36 R：5'  GGAAAAGTTAAAGTCTTCCAAT  3'37 F：5'  AGGATAATAGCGAAGGACCCAC  3'37 R：5'  AAAGGTTTCCACTCACCAACT  3'38 F：5'  TAAAGGTAAAAGGGTTGTGGG  3'38 R：5'  CTGTTGACTGGCGTGATGTAG  3'39 F：5'  TTCTCATTTTATGGCAAGGTTC  3'39 R：5'  AGGCATCAGGTCAGTCAAGG  3'40 F：5'  CGATAAATTGTTTCCAAGTT  3'40 R：5'  TCATCTTTTCAGTCTGGGGTC  3'41 F：5'  CAGCAAAAGATGGTTAGCAGG  3'41 R：5'  AGAATCATACAGGGACAGAAAC  3'42 F：5'  TAGTGAGTCAGCACCTTGGC  3'42R：5'  GCTTTAGCACCCTGTTTTCC  3'。