[发明专利]一种rDNA ITS2序列标记快速鉴定西施舌群体的方法有效

专利信息
申请号: 201310425234.6 申请日: 2013-09-17
公开(公告)号: CN103497995A 公开(公告)日: 2014-01-08
发明(设计)人: 陈淑吟;吉红九;陆勤勤;张美如 申请(专利权)人: 江苏省海洋水产研究所
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68
代理公司: 上海泰能知识产权代理事务所 31233 代理人: 黄志达
地址: 226007 江*** 国省代码: 江苏;32
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摘要: 发明涉及一种rDNA ITS2序列标记快速鉴定西施舌群体的方法,包括:(1)采集西施舌个体,提取DNA;(2)合成rDNA的ITS2序列标记引物;(3)对西施舌群体样品进行ITS2序列的PCR扩增;(4)对PCR产物进行纯化;(5)对纯化的PCR产物进行测序和序列比对,得出特异性位点,判断样品所属。本发明结果稳定,可重复性强,鉴别方法简单,对该贝类的种质资源保护和科学利用具有重要意义。
搜索关键词: 一种 rdna its2 序列 标记 快速 鉴定 西施 群体 方法
【主权项】:
一种rDNA ITS2序列标记快速鉴定西施舌群体的方法,包括:(1)采集不同群体的西施舌个体,取西施舌样品的闭壳肌组织,提取基因组总DNA,洗脱定溶于TE溶液或双蒸水中,‑20℃保存,备用时于4℃保存;(2)以ITS2‑F:5′‑GGGTCGATGAAGAACGCAG‑3′和ITS2‑R:5′‑GCTCTTCCCGCTTCACTCG‑3′为引物,进行ITS2序列的PCR扩增;然后PCR扩增产物经1.2%‑1.5%琼脂糖凝胶电泳进行检测,检测完毕进行切胶并利用PCR产物纯化试剂盒纯化回收,纯化产物进行双向测序列,其中无法直接测序的PCR产物,经克隆并进行菌落PCR检验后再测序;应用软件进行不同序列比对,得出特异性位点,判断样品所属。
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