[发明专利]西瓜MLO型抗白粉病基因快速鉴定

摘要

本发明是快速鉴定西瓜抗白粉病基因；涉及到植物比较基因组学，遗传学和生物信息学等学科知识，属于植物生物技术科学领域。该发明主要步骤为：1)西瓜全基因组序列的下载及MLO型基因的采集；2)MLO型基因的鉴定；3)MLO型基因系统发育关系；4)MLO型白粉病基因的比对。该发明有效的缩短了西瓜白粉病基因挖掘周期，有利于白粉病基因的快速鉴定；通过鉴定的候选白粉病基因开发相应的共分离功能性标记(SNP、SCAR等)，还可以快速的用于抗白粉病基因的分子标记辅助选择，准确性高；结合其它抗病基因分子标记可进行多抗性育种材料的创制，缩短育种年限，提高育种效率；为阐述西瓜抗白粉病分子机制奠定了基础。

主权项

西瓜抗白粉病基因，其特征在于选自下列3个基因或其之一：cla005044氨基酸序列：MAAAAGGKSLEQTPTWAVAVVCFVLLLISIFIEYSLHLIGHWLKKRHKRALFEALEKIKSELMLLGFISLLLTVGQGPITEICIPQHVAATWHPCTKEKESEMNKMGDQSVQHLSTNGRRLLHLAGNGGSFRRILAAAGGADKCAAKGQVSFISAEGIHQLHIFIFVLAVFHVLYCVLTYALARAKMRSWKTWEKETKTAEYQFSHDPERFRFARDTSFGRRHLSFWTKNPALMWIVCFFRQFVRSVPKVDYLTLRHGFIMAHLAPQSHTQFDFQKYINRSLEEDFKVVVGISPPIWFFAVLFLLSNTHGWRAYLWLPFIPLIILLLIGTKLQVIITKMALRIQERGEVVKGVPVVEPGDDLFWFNRPRLILYLINFVLFQNAFQVAFFAWTWYEFGLNSCFHEHTEDVVIRISMGVIVQILCSYVTLPLYALVTQMGSTMKPTIFNERVAAALRNWYHSARKHIKHNRGSITPMSSRPATPTHSMSPVHLLRHYKSEVDSFHNSPRRSPFDTDRWDNDSPSPSRHADGSSSSQPHIEMGGYDKDPTEPGSTQIDPVQSSQTRTQHEIQIGGPKDFSFNRTE核苷酸序列：ATGGCGGCTGCAGCCGGTGGCAAGTCGCTCGAGCAAACGCCGACGTGGGCCGTTGCGGTTGTTTGCTTCGTTTTGCTTCTCATCTCTATTTTCATCGAATATAGCCTCCATCTCATCGGACATTGGCTGAAGAAGAGACACAAACGGGCGTTATTTGAAGCACTAGAGAAGATCAAATCAGAGCTTATGTTATTGGGATTCATATCGCTGCTTCTAACAGTGGGGCAAGGTCCAATCACAGAGATATGTATCCCTCAACATGTAGCTGCCACGTGGCATCCATGTACAAAGGAGAAAGAAAGTGAGATGAACAAAATGGGGGATCAATCTGTGCAACATTTGTCTACTAATGGCCGGAGACTCCTCCATCTCGCCGGAAATGGTGGAAGTTTCCGGCGGATTTTGGCCGCGGCCGGAGGAGCCGACAAGTGTGCTGCCAAGGGTCAAGTGTCGTTTATTTCAGCAGAAGGAATTCATCAACTTCATATCTTCATATTTGTGTTGGCTGTTTTCCATGTTTTGTACTGTGTTCTTACTTATGCTTTGGCTAGAGCAAAGATGAGGAGTTGGAAAACTTGGGAAAAAGAGACCAAAACTGCAGAATACCAATTCTCACATGATCCGGAGAGATTTAGGTTTGCAAGAGACACCTCGTTTGGGAGGAGACATTTGAGCTTCTGGACAAAGAATCCTGCCCTAATGTGGATAGTTTGTTTCTTCAGGCAATTTGTAAGATCTGTTCCAAAAGTTGATTACTTGACATTAAGACATGGGTTTATAATGGCACATTTAGCACCTCAAAGTCATACACAATTTGATTTTCAAAAATACATTAATCGATCTCTTGAAGAGGACTTCAAAGTTGTCGTGGGAATCAGCCCACCAATTTGGTTCTTCGCTGTGCTGTTTCTCCTCTCAAACACTCACGGTTGGAGGGCATATCTATGGCTGCCGTTCATCCCACTAATCATTTTGCTGCTGATCGGGACAAAGTTGCAAGTGATCATAACGAAAATGGCACTGAGAATACAAGAAAGAGGAGAAGTAGTGAAGGGCGTGCCAGTGGTTGAGCCTGGCGATGACCTTTTTTGGTTCAATCGCCCTCGCCTTATTCTTTATCTCATCAACTTTGTTCTCTTTCAAAATGCCTTCCAAGTTGCCTTCTTTGCTTGGACTTGGTATGAGTTCGGGTTGAATTCTTGTTTCCATGAGCATACAGAGGATGTGGTGATCCGAATTTCAATGGGGGTGATTGTACAAATCCTTTGCAGTTATGTTACTCTTCCTCTTTATGCACTGGTCACTCAGATGGGTTCAACAATGAAGCCAACTATATTCAATGAGAGAGTGGCAGCGGCCCTTCGCAATTGGTACCACTCGGCTCGGAAGCACATCAAACACAACCGCGGTTCGATCACTCCAATGTCGAGCCGACCTGCCACCCCGACTCACAGCATGTCACCGGTCCACCTTCTCCGTCACTACAAGAGTGAGGTCGATAGCTTCCACAACTCGCCGAGAAGGTCACCATTTGACACTGATCGTTGGGACAACGATTCGCCCTCACCGTCCCGTCATGCTGATGGTTCGTCTTCATCACAACCCCACATCGAGATGGGAGGCTATGACAAAGATCCGACCGAACCGGGGTCGACTCAAATTGACCCGGTTCAATCATCTCAAACCCGGACTCAACATGAGATTCAAATTGGCGGCCCCAAAGACTTTTCCTTTAACAGAACAGAGTGAcla008753氨基酸序列：MAGGAAGRSLEETPTWAVAAVCFVLVLISIIIEHILHLIGKWLKKKHKRALNEALEKIKSELMLLGFISLLLTVGQSLITNVCIPPNVAATWHPCSPQREQELTKQADLLLDSSDHNRRKLLAVSHVNATFRRALAAAGGTDKCAAKGKVPFVSEGGIHQLHIFIFVLAVFHVLYCVLTLALGNAKMRSWKSWEKETRTVEYQFSHDPERFRFARDTSFGRRHLSFWTKSPFLIWIVCFFRQFVRSVPKVDYLTLRHGFVMAHLAPQSDQKFDFQKYIKRSLEEDFKVVVSISPPIWFFAVLFLLFNTHGWRAYLWLPFVPLVIVLLVGTKLQVIITKMALRIQERGEVVKGVPVVEPGDDLFWFNRPRLILYLINFVLFQNAFQLAFFAWTWKEFGMKSCFHEHTEDLVIRITMGVLVQILCSYVTLPLYALVTQMGSTMKPTIFNEKVATALRNWHHTARKHIKQNRGSLTPMSSRPTTPSHHMSPVHLLRHYRSELDSVHTSPRRSNFDNDHWDPDSPSPSHHFHRRPQAADGSGSYSHHHRDVEAGDVDVVNDSTRPNPTTNSRDPDVQRTNNNSEQHEIDVGPSDFSFDRRVNKV核苷酸序列：ATGGCCGGAGGTGCCGCCGGAAGGTCCTTGGAAGAGACGCCGACGTGGGCCGTCGCCGCCGTCTGCTTTGTTTTGGTTCTAATTTCTATCATCATCGAACACATTCTCCATCTCATCGGAAAGTGGCTAAAGAAGAAGCATAAACGAGCTCTCAACGAAGCTCTCGAGAAGATCAAATCAGAGCTGATGTTGTTGGGATTCATATCGCTGCTGCTGACGGTGGGACAAAGCTTAATCACCAATGTTTGTATTCCACCGAACGTGGCTGCCACGTGGCATCCATGTAGTCCTCAAAGAGAACAGGAATTAACCAAACAAGCTGACCTTCTTCTCGATTCTTCCGACCATAATCGCCGGAAACTTCTCGCCGTCTCCCATGTCAATGCCACTTTCCGCCGTGCTCTCGCCGCTGCCGGTGGAACCGATAAATGTGCTGCTAAGGGTAAAGTCCCGTTTGTTTCGGAAGGAGGTATTCATCAGCTACATATATTCATCTTCGTGTTGGCTGTTTTCCACGTTTTGTATTGTGTCTTAACTCTAGCGTTGGGCAATGCCAAGATGAGAAGTTGGAAGTCGTGGGAAAAGGAGACTAGAACCGTGGAGTACCAATTTTCACATGATCCAGAACGGTTTCGATTTGCAAGGGACACATCATTCGGGAGAAGACATTTAAGCTTTTGGACCAAATCTCCTTTCCTCATATGGATTGTTTGTTTCTTCAGACAATTCGTAAGGTCAGTTCCAAAGGTTGATTACTTGACCTTAAGACATGGTTTCGTCATGGCTCATTTGGCACCACAAAGCGATCAAAAATTTGACTTTCAAAAATACATCAAACGCTCTCTTGAAGAAGATTTCAAGGTGGTGGTCAGTATCAGCCCTCCGATCTGGTTCTTCGCTGTTCTCTTCCTACTTTTCAACACCCACGGCTGGAGGGCTTATCTATGGCTACCATTTGTGCCATTAGTTATAGTTTTGTTGGTAGGGACTAAATTGCAAGTGATAATAACGAAAATGGCCCTGAGGATACAAGAAAGAGGGGAAGTGGTGAAGGGAGTGCCAGTGGTAGAGCCAGGGGATGACCTTTTTTGGTTCAATCGCCCTCGTCTTATTCTTTACTTAATCAATTTTGTGCTCTTTCAAAACGCTTTTCAGCTTGCTTTCTTTGCTTGGACTTGGAAAGAATTTGGGATGAAATCTTGTTTCCATGAGCACACAGAGGATTTGGTGATCAGAATAACAATGGGAGTCTTGGTTCAAATCCTTTGCAGTTACGTTACATTGCCTCTTTACGCTCTAGTCACACAGATGGGTTCGACGATGAAGCCCACAATTTTCAATGAAAAAGTAGCGACAGCATTGAGAAACTGGCACCACACAGCTCGCAAACACATCAAGCAAAATCGTGGCTCACTAACGCCAATGTCCAGCCGCCCCACCACCCCCTCCCACCACATGTCGCCGGTCCACCTCCTCCGCCACTACCGGAGCGAATTGGATAGCGTCCATACCTCTCCTAGAAGATCCAATTTCGACAACGACCATTGGGACCCAGATTCCCCCTCTCCTTCCCACCACTTCCACCGTCGCCCCCAAGCCGCCGACGGCTCCGGTTCCTACAGCCACCATCATCGCGATGTGGAGGCCGGTGATGTCGATGTCGTCAATGATTCGACCCGACCCAACCCGACAACCAATTCAAGGGATCCAGATGTTCAACGAACGAATAATAATTCCGAGCAACATGAAATTGATGTGGGACCCAGTGATTTTTCGTTTGATAGAAGAGTTAATAAAGTATGAcla020573氨基酸序列：MADCGTEQRTLEDTSTWAVAVVCFFLVVISIFIEHVIHLTGKWLEKRHKPALVEALEKVKAGQDAVTQICVSKELATTWLPCAAKAKTGVKVAKNSRLKLLEFLDPDYGSRRILASKGDDACAKRGQLAFVSAYGIHQLHIFIFVLAVFHVLYCITTLALGRTKMSKWKAWEDETKTIEYQYYNDPARFRFARDTTFGRRHLSFWSRTPLSLWIVCFFRQFFGSVTKVDYMTLRHGFIVAHLAPGSEVKFDFHKYISRSLEDDFKVVVGISPAMWLFAVLFILTNTNGWYSYLWLPFISLVIILLVGTKLHVIITQMGLTIQERGHVVKGVPVVQPRDDLFWFGRPQLILFLIHFVLFMNAFQLAFFAWTTYAFKWRACFHQRIEDIAIRLSMGVIIQVLCSYVTLPLYALVTQMGSNMRPTIFNDRVATALKNWHHSAKKNMKHQRNPDSTSPFSSRPTTPTHGMSPIHLLHKHQHGSTSPRLSDAEPDRWDIEELPPSSHHSRAHDNQEQEHSETNREQEMTVQRPSSTETSSMTRPARPQHEITRSPSDFSFAK核苷酸序列：ATGGCTGATTGTGGAACAGAGCAGCGTACTCTGGAGGATACTTCAACTTGGGCTGTTGCGGTTGTTTGTTTTTTCTTGGTTGTTATTTCAATCTTCATTGAACATGTCATTCATCTCACTGGAAAGTGGCTGGAGAAAAGGCACAAGCCAGCTCTTGTTGAAGCTCTAGAAAAGGTTAAAGCAGGCCAAGATGCTGTCACTCAAATTTGTGTTTCGAAGGAGCTTGCGACAACTTGGCTTCCATGTGCAGCAAAAGCCAAAACAGGAGTAAAAGTTGCGAAGAACAGTCGTCTTAAACTTCTTGAATTTTTAGATCCTGACTATGGTTCGAGGCGTATTTTAGCCTCAAAAGGAGACGATGCGTGCGCTAAGAGGGGTCAACTTGCTTTCGTGTCTGCATATGGAATCCACCAGCTCCATATTTTCATCTTTGTATTGGCTGTTTTCCATGTTCTATACTGCATCACCACTTTGGCTTTGGGCAGAACAAAGATGAGCAAATGGAAGGCCTGGGAGGATGAGACAAAAACAATTGAATACCAGTACTATAATGATCCAGCAAGATTTAGATTTGCCAGAGATACAACATTTGGACGCCGGCACTTGAGCTTTTGGAGTCGTACACCACTTTCCCTCTGGATTGTTTGTTTCTTCCGACAATTCTTTGGATCAGTTACCAAGGTTGATTACATGACACTGAGGCATGGATTCATCGTTGCACATCTAGCGCCCGGAAGTGAAGTAAAATTCGATTTCCATAAATACATCAGCAGATCTCTCGAAGACGACTTTAAAGTTGTTGTGGGGATTAGTCCAGCAATGTGGCTATTTGCTGTTCTCTTCATCCTAACCAATACAAATGGGTGGTATTCATATCTATGGCTGCCTTTCATCTCCTTAGTTATAATTCTGTTGGTGGGAACGAAGCTCCATGTTATCATAACTCAAATGGGATTGACAATTCAAGAAAGGGGCCACGTTGTGAAGGGTGTTCCCGTCGTTCAGCCCCGGGATGACCTGTTTTGGTTCGGACGTCCACAACTTATTCTCTTTCTGATTCACTTTGTTCTCTTTATGAATGCATTTCAGCTTGCCTTCTTTGCTTGGACCACGTACGCATTTAAGTGGAGAGCTTGCTTCCATCAACGAATTGAAGATATTGCCATCAGACTCTCAATGGGGGTTATCATACAAGTTCTATGCAGTTATGTGACACTCCCACTCTATGCTTTGGTGACTCAGATGGGCTCTAATATGAGACCAACCATTTTCAACGACCGAGTGGCGACGGCATTGAAGAACTGGCACCACTCTGCCAAGAAGAACATGAAGCACCAGCGCAACCCAGACAGTACCTCACCATTCTCAAGCAGGCCAACTACTCCAACTCACGGCATGTCTCCTATTCACCTTCTGCACAAACATCAGCATGGCAGCACATCTCCCAGGCTATCTGATGCAGAACCAGATCGTTGGGACATTGAAGAGTTGCCTCCTTCTTCACACCATAGTAGAGCCCATGATAATCAAGAACAAGAACATTCTGAGACAAATAGAGAACAGGAGATGACAGTTCAACGGCCAAGTTCAACAGAAACTAGTTCCATGACACGTCCTGCTCGCCCTCAACATGAAATCACTAGGAGTCCCTCAGACTTCTCATTTGCCAAATGA。