[发明专利]荧光染料修饰的核苷酸及类似物的固相合成方法在审

专利信息
申请号: 201310580357.7 申请日: 2013-11-20
公开(公告)号: CN104650170A 公开(公告)日: 2015-05-27
发明(设计)人: 马东杰;张伟 申请(专利权)人: 上海毕欧桥生物科技有限公司
主分类号: C07H19/10 分类号: C07H19/10;C07H1/00;C09K11/06
代理公司: 代理人:
地址: 201204 上海市徐*** 国省代码: 上海;31
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摘要: 荧光染料修饰的核苷酸及类似物的固相合成方法。本发明涉及荧光染料修饰的核苷酸及类似物的固相合成方法。 (I)
搜索关键词: 荧光 染料 修饰 核苷酸 类似物 相合 成方
【主权项】:
制备式(I)荧光染料修饰的核苷酸及类似物的固相合成方法,(I)其中取代基具有以下的含义:M是H, Na或KR1为H或OHR2为H或OHR3为C1‑C8直链烷基(CH2)nBase为具有下列结构的碱基或碱基类似物取代基:Dye为具有下列结构的荧光染料取代基团:其中取代基具有以下的含义:R4为OH, NH2, N(Me)2或N(Et)2, N(Pr)2R5为O,或NH2+, N(Me)2+或N(Et)2+, N(Pr)2+R6为H, F, Cl,Br或IR7和R8为H或CH2NH2,或者具有以下结构的取代基:R9为H,CH3或CH2CH3其特征是包括以下步骤:a.将式(II)化合物(II)Base为具有下列结构的碱基或碱基类似物取代基:用DMF溶解,再加入氢氧化钠和树脂,搅拌均匀,振荡反应;再分别用N,N’‑二甲基甲酰胺,二氯甲烷,醋酸水溶液和甲醇洗涤后,得到式(III)化合物(III);b.将式(IV)化合物(IV)其中FMOC为芴甲氧羰基与式(III)化合物,碘化铜以及无水DMF混合,在氮气保护下, 注入无水三乙胺,在氮气的保护下,投入四(三苯基膦)钯, 反应结束后,再分别用N,N’‑二甲基甲酰胺,二氯甲烷,醋酸水溶液和甲醇洗涤后,再加入六氢吡啶的N,N’‑二甲基甲酰胺溶液,去掉芴甲氧羰基,得到式(V)化合物(V);c.将式(VI)化合物(VI)R10和R11为H或芴甲氧羰基氨基甲基,或者具有以下结构的取代基:与式(V)混合于N,N’‑二甲基甲酰胺中,加入羟基苯并三唑, N,N'‑二异丙基碳二亚胺和DMAP4‑二甲氨基吡啶,经酰胺化反应后,再分别用N,N’‑二甲基甲酰胺,二氯甲烷,醋酸水溶液和甲醇洗涤,获得式(VII)化合物;R10和R11为芴甲氧羰基氨基甲基时,树脂洗涤后加入六氢吡啶的N,N’‑二甲基甲酰胺溶液,去掉芴甲氧羰基后获得式(VII)化合物然后加入六氢吡啶的N,N’‑二甲基甲酰胺溶液,去掉芴甲氧羰基后获得式(VII)化合物(VII);d. 在所得的式(VII)化合物中加入盐酸,振荡后过滤,取滤液洗涤后冻干得到式(I)化合物。
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