[发明专利]一种由生物芯片数据构建多类别特异表达分子集及类别网的方法及其应用和评价方法

摘要

本发明提供的由生物芯片数据构建多类别特异表达分子集及类别网的方法包括设置和输入n组芯片数据；筛选多组间差异表达的分子；计算差异表达分子在任意两组间的表达差异，得到每个分子的差异表达模式编码；将具有相同编码模式的分子归为同一组，得到m个阶段特异表达分组；采用单侧Fisher精确检验进行富集分析，得到类别特异表达的分子集合；构建各状态间的连接网络，得到类别网。该方法有利于对疾病状态进展的预测，对临床的诊疗具有重要意义。此外，本发明还提供了一种评价由生物芯片数据构建的多类别特异表达分子集的分类能力的方法，以及一种由生物芯片数据构建多类别特异表达分子集及类别网的方法的应用。

主权项

一种由生物芯片数据构建多类别特异表达分子集及类别网的方法，其特征在于，包括以下步骤：(1)设置和输入n组芯片数据；所述n不小于3，所述n组芯片数据的分组依据为根据不同生理状态将数据进行分组；(2)筛选多组间差异表达的分子，包括：对任意一个分子进行多组间的单因素方差分析，并为所得统计值设定阈值；判断所得统计值是否符合阈值要求，如果判断结果为否，则抛弃；如果判断结果为是，则输出识别结果，执行下一步；(3)通过统计学检验的方法计算多组间差异表达分子在任意两组间的表达差异，为所得统计值设定阈值；并针对多组间差异表达分子中的每个分子，构建长度为的向量，如果所得统计值高于阈值，则在向量中相应的位置记为0，反之，记为1，得到多组间差异表达分子中的每个分子的差异表达模式编码；(4)根据步骤(3)所得每个分子的差异表达模式编码将分子进行分组，其中，具有相同编码模式的分子归为同一组，得到m个阶段特异表达分组；(5)筛选多组间差异表达的分子，包括采用Fisher精确检验对所得m个阶段特异表达分组进行富集分析，包括：以基因注释生物学信息为对照，对各阶段特异表达分组中的每个分子进行注释，保留各阶段特异表达分组中可以富集到相同生物功能节点的分子，组成类别特异表达的分子集合；(6)根据类别特异分子集构建各状态间的连接网络，得到类别网。