[发明专利]用于产生和使用最佳核苷酸流顺序的系统和方法在审
| 申请号： | 201380025917.0 | 申请日： | 2013-05-16 |
| 公开（公告）号： | CN104364789A | 公开（公告）日： | 2015-02-18 |
| 发明（设计）人： | 陈怡儒;C.T.A.黄 | 申请（专利权）人： | 霍夫曼－拉罗奇有限公司 |
| 主分类号： | G06F19/22 | 分类号： | G06F19/22 |
| 代理公司： | 中国专利代理(香港)有限公司 72001 | 代理人： | 杜艳玲;梁谋 |
| 地址： | 瑞士*** | 国省代码： | 瑞士;CH |
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| 摘要： | 描述了用于产生尽可能降低序列数据中相位同步误差的累积的流顺序的方法的实施方案，其包括以下步骤： (a)产生包含k碱基长度的核苷酸种类的多个序列排序，其中所述序列排序定义将核苷酸种类引入边合成边测序反应环境的序列；(b)使用所述序列排序模拟从一个或更多个参考基因组获取序列数据，其中所述序列数据包含相位同步误差的累积；和(c)使用读取长度参数和延伸率参数选择所述序列排序中的一个或更多个。 | ||
| 搜索关键词： | 用于 产生 使用 最佳 核苷酸 顺序 系统 方法 | ||
【主权项】：
用于产生尽可能降低序列数据中相位同步误差的累积的流顺序的方法，其包括以下步骤：(a) 产生包含k碱基长度的核苷酸种类的多个序列排序，其中所述序列排序定义将核苷酸种类引入边合成边测序反应环境的序列；(b) 使用所述序列排序模拟从一个或更多个参考基因组获取序列数据，其中所述序列数据包含相位同步误差的累积；和(c) 使用读取长度参数和延伸率参数选择所述序列排序中的一个或更多个。
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G06 计算；推算；计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学，即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真，例如：概率模型或动态模型，遗传基因管理网络，蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的，例如：进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的，例如：结构排序，结构或功能关系，蛋白质折叠，结构域拓扑，用结构数据的药靶，涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的，例如：基因型–表型关联，不均衡连接，种群遗传学，结合位置鉴定，变异发生，基因型或染色体组的注释，蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
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