[发明专利]预测肾细胞癌的预后的方法

摘要

为了提供简便且灵敏度和特异性高的检测肾细胞癌预后不良的风险的方法，对正常肾组织、来自肾细胞癌患者的非癌组织和肾细胞癌进行了甲基化组分析。结果表明，通过检测FAM150A，GRM6，ZNF540，ZFP42，ZNF154，RIMS4，PCDHAC1，KHDRBS2，ASCL2，KCNQ1，PRAC，WNT3A，TRH，FAM78A，ZNF671，SLC13A5和NKX6‑2基因的至少一个CpG位点的DNA甲基化水平，能够检测肾细胞癌预后不良的风险。

主权项

1.基因用于制造检测肾细胞癌的预后不良风险的试剂盒的用途，所述基因选自以下基因组成的基因群：FAM150A、GRM6、ZNF540、ZFP42、ZNF154、RIMS4、ASCL2、PRAC、WNT3A、TRH、ZNF671和SLC13A5，所述检测包括以下(1)～(3)的步骤:(1)制备来自受试者肾脏组织的基因组DNA的步骤，(2)对于步骤(1)制备的基因组DNA，检测所述基因群中的至少一个CpG位点的DNA甲基化水平的步骤，所述CpG位点选自以下CpG位点组成的CpG位点群：序列号4所记载的碱基序列中的第8、9、10、13、14、15、18、19、21、22、26、27、28、29、30、31、37、38、39、41和42位的CpG位点，序列号5所记载的碱基序列中的第1、2、4和5位的CpG位点，序列号10所记载的碱基序列中的第3、4、6、9、10、11、12、13、15、24、25和26位的CpG位点，序列号6所记载的碱基序列中的第3、4、5、7和8位的CpG位点，序列号7所记载的碱基序列中的第1、4、5、6、8、11和12位的CpG位点，序列号8所记载的碱基序列中的第15和17位的CpG位点，序列号16所记载的碱基序列中的第9和10位的CpG位点，序列号12所记载的碱基序列中的第2、3、4、7和8位的CpG位点，序列号14所记载的碱基序列中的第7、8和9位的CpG位点，序列号9所记载的碱基序列中的第2、3、4、5、11、12、13、25、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、39、40和41位的CpG位点，序列号13所记载的碱基序列中的第4、10、14、20、26、28、29、31和33位的CpG位点，序列号1所记载的碱基序列中的第3、4、5、9、10、11、12、13、14、15、21、22、23、24、25、26、30、31、34、35、40、41、42、43和44位的CpG位点，序列号2所记载的碱基序列中的第1、2、15、16、17、18、19、20、26、32、33、35、36和37位的CpG位点，和序列号3所记载的碱基序列中的第3、5、6、7、8、9、10、13、14、20和21位的CpG位点，(3)根据步骤(2)检测到的DNA甲基化水平，确定所述受试者是否分类为预后不良组的步骤。