[发明专利]个性化癌症疫苗和过继免疫细胞治疗

摘要

鉴定了在来自癌症患者的癌细胞的表达基因中含有突变的癌抗原。通过将使用平行测序平台获得的来自癌细胞的序列与患者的正常基因或来自HLA匹配个体的正常基因比较来对该序列进行选择。通过鉴定癌症患者的HLA超类型并针对该HLA超类型选择在受影响基因中突变位置和/或相应野生型位置处具有特定氨基酸的序列，从而对序列进行进一步选择。可任选测试含有癌抗原的肽与癌症患者的HLA抗原的结合。评估含有癌抗原的肽对来自癌症患者或来自HLA匹配供体的细胞毒性T淋巴细胞(CTL)细胞系的激活。针对癌症患者鉴定的癌抗原用于制备癌症疫苗并用于治疗该癌症患者。

主权项

1.一种制备用于治疗癌症患者的肿瘤特异性细胞毒性T淋巴细胞(CTL)的方法，包括：‑鉴定从所述癌症患者的癌细胞的核酸的癌抗原，所述鉴定包括：a)获取来自癌症患者的癌细胞的核酸的多条突变序列，所述突变序列编码所有或部分表达基因且所述突变序列各具有突变位置氨基酸，所述突变位置氨基酸取代了野生型蛋白序列中同一位置的野生型位置氨基酸，所述突变序列通过使用平行测序平台获得，所述平行测序平台对所述癌细胞的核酸进行平行处理以生成序列读数并将序列读数映射至具有参考基因序列的数据库；以及b)通过鉴定所述癌症患者的HLA型或超类型并随后使用图7为所述HLA型或超类型选择作为所述突变位置氨基酸和/或野生型位置氨基酸的氨基酸来从步骤a)中鉴定到的序列中选择突变序列，‑合成包含来自步骤b)的所述选择的突变序列的肽；和‑通过使来自HLA匹配供体的血液单核细胞在体外接触所述肽，以刺激肿瘤特异性细胞毒性T淋巴细胞(CTL)细胞。