[发明专利]批准预测装置、批准预测方法及计算机可读记录介质

摘要

本发明的批准预测装置、批准预测方法计算构成蛋白质相似性网络的蛋白质的中心性尺度即相似性中心性尺度，计算构成蛋白质间相互作用网络的蛋白质的中心性尺度即相互作用中心性尺度，使用将各药剂的批准属性、相似性中心性尺度的各药剂的每个靶标的合计值以及平均值、和相互作用中心性尺度的各药剂的每个靶标的合计值以及平均值作为训练数据的分类器，来计算将验证对象的化合物分类为不批准的药剂的概率即否决得分，输出否决得分。

主权项

一种批准预测装置，至少具备输出部、存储部和控制部，上述批准预测装置的特征在于，上述存储部具备：蛋白质排列信息存储单元，其存储与蛋白质的氨基酸排列相关的排列信息；相似性网络信息存储单元，其存储与基于蛋白质彼此的相似性而构成的蛋白质相似性网络相关的相似性网络信息；药剂靶标存储单元，其将包含与药剂的批准或不批准相关的批准属性的药剂信息、和与成为该药剂的靶标的上述蛋白质相关的蛋白质信息建立对应并存储；和相互作用网络信息存储单元，其存储与基于上述蛋白质间的相互作用而构成的蛋白质间相互作用网络相关的相互作用网络信息，上述控制部具备：相似性网络信息保存单元，其在基于存储在上述蛋白质排列信息存储单元中的上述排列信息，使用基于签名算法相互检测到上述蛋白质彼此的上述相似性的情况下，建立由相互检测到上述相似性的上述蛋白质彼此构成的上述蛋白质相似性网络，将与该蛋白质相似性网络相关的上述相似性网络信息保存在上述相似性网络信息存储单元；相似性中心性尺度计算单元，其基于存储在上述相似性网络信息存储单元中的上述相似性网络信息，计算构成上述蛋白质相似性网络的上述蛋白质的包含度中心性、介数中心性、距离的中心性、以及Burt的约束值在内的中心性尺度即相似性中心性尺度；相互作用中心性尺度计算单元，其基于存储在上述相互作用网络信息存储单元中的上述相互作用网络信息，计算构成上述蛋白质间相互作用网络的上述蛋白质的包含上述度中心性、上述介数中心性、上述距离的中心性、以及上述Burt的约束值的中心性尺度即相互作用中心性尺度；否决得分计算单元，其使用将存储在上述药剂靶标存储单元中的各药剂的上述批准属性、由上述相似性中心性尺度计算单元计算出的上述相似性中心性尺度的上述各药剂的每个上述靶标的合计值以及平均值、和由上述相互作用中心性尺度计算单元计算出的上述相互作用中心性尺度的上述各药剂的每个上述靶标的合计值以及平均值作为训练数据的分类器，来计算将验证对象的化合物分类为上述不批准的上述药剂的概率即否决得分；和否决得分输出单元，其经由上述输出部使由上述否决得分计算单元计算出的上述否决得分输出。