[发明专利]为数字PCR实验设计者所用的方法和系统有效
申请号: | 201380052860.3 | 申请日: | 2013-09-13 |
公开(公告)号: | CN104937600B | 公开(公告)日: | 2018-01-16 |
发明(设计)人: | 奈弗蒂塔·苏米·马朱木达尔;托马斯·维塞尔;大卫·C·伍欧;马克新·希克拉;戈登·亚纳威;史韦塔·莱贾德;乔安娜·兰科斯特尔;杰弗里·马克斯;丹尼尔·维塞尔 | 申请(专利权)人: | 生命技术公司 |
主分类号: | G06F19/24 | 分类号: | G06F19/24 |
代理公司: | 北京英赛嘉华知识产权代理有限责任公司11204 | 代理人: | 王达佐,王艳春 |
地址: | 美国加利*** | 国省代码: | 暂无信息 |
权利要求书: | 查看更多 | 说明书: | 查看更多 |
摘要: | 提供一种用于设计数字PCR(dPCR)实验的计算机实施的方法。所述方法包含从用户处接收优化类型的选择。所述优化类型可以是例如将动态范围增至最大、将包含用于所述实验所需的反应部位的衬底的数目减到最小、确定稀释因子或确定检测的下限。所述方法进一步包含从所述用户处接收用于实验的精度测量,以及用于所述实验的反应部位中目标的最小浓度。所述方法还包含基于所述优化类型确定用于所述实验的一组dPCR实验设计因素。随后向所述用户显示所述dPCR实验设计因素组。 | ||
搜索关键词: | 数字 pcr 实验 设计者 所用 方法 系统 | ||
【主权项】:
一种用于设计数字PCR(dPCR)实验的方法,所述方法包括:从用户处接收对实验的检测属性进行优化的优化类型的选择;从所述用户处接收与所述优化类型对应的至少一个约束,所述至少一个约束包括精度测量;从所述用户处接收用于所述实验的反应部位中目标的最小浓度;基于所述优化类型和所述精度测量确定用于所述实验的一组dPCR实验设计因素;从所述用户处接收将在所述实验中使用的储备溶液信息;确定储备液‑反应混合物稀释因子;并且向所述用户显示所述dPCR实验设计因素组和所述储备液‑反应混合物稀释因子。
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G06 计算;推算;计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
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