[发明专利]开发用于评估法医样品中DNA降解和质量的高灵敏度定量系统在审
| 申请号： | 201380052972.9 | 申请日： | 2013-08-13 |
| 公开（公告）号： | CN104718300A | 公开（公告）日： | 2015-06-17 |
| 发明（设计）人： | 素德赫·辛哈 | 申请（专利权）人： | 素德赫·辛哈 |
| 主分类号： | C12Q1/68 | 分类号： | C12Q1/68;C07H21/02;C12P19/34 |
| 代理公司： | 北京英赛嘉华知识产权代理有限责任公司 11204 | 代理人： | 王达佐;洪欣 |
| 地址： | 美国路易*** | 国省代码： | 美国;US |
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| 摘要： | 描述了对人DNA样品中存在的降解程度进行定量的方法。该方法利用实时PCR系统以对样品中第一反转录转座子散布元件和相对较长的第二反转录转座子散布元件分别进行定量，其中随着所述样品降解，所述较长的元件预期以比所述较短元件更快的速度瓦解。在一实施方案中，该方法利用(在进化水平上)相对年轻的Alu Yb系亚家族序列在每个人基因组中的出现以及它们在非人样品中的基本上不存在。在优选实施方案中，该方法对“SVA”元件的较长的290bp的序列和Alu Yb8系的较短的80bp的序列进行定量。介绍了在该方法中有用的新设计的引物和TaqMan探针。相关方法还对男性特异性人DNA进行定量。 | ||
| 搜索关键词： | 开发 用于 评估 法医 样品 dna 降解 质量 灵敏度 定量 系统 | ||
【主权项】：
对样品中人DNA进行定量从而评价其中DNA降解程度的方法，所述方法包括以下步骤：提供待分析的样品；使用实时聚合酶链反应系统对样品中第一反转录转座子散布元件和第二反转录转座子散布元件分别进行定量，所述第一反转录转座子散布元件为Alu元件，所述第二反转录转座子散布元件为RP基因的SVA元件；和计算样品中所述第一反转录转座子散布元件的出现率与所述第二反转录转座子散布元件的出现率的比率。
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