[发明专利]肝脏相关的炎性疾病的基因标记

摘要

本发明涉及在代谢和自身免疫性疾病中表征与肠道微生物群相关的炎症的领域。尤其是，涉及基因标记的鉴定，所述基因标记能用作预测炎症相关疾病或自身免疫性疾病的标记物，其中炎症相关疾病比如肝脏相关的代谢疾病，尤其是良性脂肪变性向其最严重形式(脂肪性肝炎和肝硬化)的演变，自身免疫性疾病尤其是炎性肠疾病(克罗恩病和溃疡性结肠炎)。因此，这些基因标记能够用作诊断、预后、药物研究分层、用于监测患者和用于指定适当治疗的手段。

主权项

1.一种用于在受试者粪便样本中体外诊断和/或预后炎性疾病的试剂盒，所述炎性疾病选自良性脂肪变性、非酒精性脂肪性肝炎、NASH肝脏纤维化和克罗恩病，所述试剂盒包含用于确定至少两个细菌基因的表达水平或丰度的核酸引物或探针，所述细菌基因选自：SEQID NO:1、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:26、SEQID NO:31、SEQ ID NO:36、SEQ ID NO:41、SEQ ID NO:46、SEQ ID NO:51、SEQ ID NO:56、SEQID NO:61、SEQ ID NO:66、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:76、SEQ ID NO:81、SEQ ID NO:86、SEQID NO:91、SEQ ID NO：96、SEQ ID NO:101和至少一个其共变基因，其中SEQ ID NO:1的共变基因选自SEQ ID NO:2至5，SEQ ID NO:6的共变基因选自SEQ ID NO:7至10，SEQ ID NO:11的共变基因选自SEQ ID NO:12至15，SEQ ID NO:16的共变基因选自SEQ ID NO:17至20，SEQID NO:21的共变基因选自SEQ ID NO:22至25，SEQ ID NO:26的共变基因选自SEQ ID NO:27至30，SEQ ID NO:31的共变基因选自SEQ ID NO:32至35，SEQ ID NO:36的共变基因选自SEQID NO:37至40，SEQ ID NO:41的共变基因选自SEQ ID NO:42至45，SEQ ID NO:46的共变基因选自SEQ ID NO:47至50，SEQ ID NO:51的共变基因选自SEQ ID NO:52至55，SEQ ID NO:56的共变基因选自SEQ ID NO:57至60，SEQ ID NO:61的共变基因选自SEQ ID NO:62至65，SEQ ID NO:66的共变基因选自SEQ ID NO:67至70，SEQ ID NO:71的共变基因选自SEQ IDNO:72至75，SEQ ID NO:76的共变基因选自SEQ ID NO:77至80，SEQ ID NO:81的共变基因选自SEQ ID NO:82至85，SEQ ID NO:86的共变基因选自SEQ ID NO:87至90，SEQ ID NO:91的共变基因选自SEQ ID NO:92至95，SEQ ID NO:96的共变基因选自SEQ ID NO:97至100，SEQID NO:101的共变基因选自SEQ ID NO:102至105。