[发明专利]用于生产特定长度脂肪醇及相关化合物的微生物和方法

摘要

本发明提供含有脂肪醇、脂肪醛或脂肪酸途径的非天然存在的微生物，其中所述微生物选择性产生具有特定长度的脂肪醇、脂肪醛或脂肪酸。另外还提供的是具有脂肪醇、脂肪醛或脂肪酸途径的非天然存在的微生物，其中所述微生物还包括乙酰‑CoA途径。在有些方面，本发明的微生物具有增加脂肪醇、脂肪醛或脂肪酸生产的选择基因破坏或酶衰减。本发明另外还提供使用上述微生物生产脂肪醇、脂肪醛或脂肪酸的方法。

主权项

非天然存在的微生物，其具有丙二酰‑CoA非依赖性脂肪酰‑CoA延长(MI‑FAE)循环和/或丙二酰‑CoA依赖性脂肪酰‑CoA延长(MD‑FAE)循环与终止途径的组合，其中所述MI‑FAE循环包含一种或多种硫解酶、一种或多种3‑氧代酰基‑CoA还原酶、一种或多种3‑羟基酰基‑CoA脱水酶及一种或多种烯酰‑CoA还原酶，其中所述MD‑FAE循环包含一种或多种延长酶、一种或多种3‑氧代酰基‑CoA还原酶、一种或多种3‑羟基酰基‑CoA脱水酶及一种或多种烯酰‑CoA还原酶，其中所述终止途径包含选自以下的途径：(1)1H；(2)1K和1L；(3)1E和1N；(4)1K,1J和1N；(5)1E；(6)1K和1J；(7)1H和1N；(8)1K,1L和1N；(9)1E和1F；(10)1K,1J和1F；(11)1H,1N和1F；(12)1K,1L,1N和1F；和(13)1G,其中1E是酰基‑CoA还原酶(醛形成)，其中1F是醇脱氢酶，其中1G是酰基‑CoA还原酶(醇形成)，其中1H是酰基‑CoA水解酶、酰基‑CoA转移酶或酰基‑CoA合酶，其中1J是酰基‑ACP还原酶，其中1K是酰基‑CoA:ACP酰基转移酶，其中1L是硫酯酶，其中1N是醛脱氢酶(酸形成)或羧酸还原酶，其中所述MI‑FAE循环、MD‑FAE循环或终止途径的酶由至少一种外源核酸编码且以足以产生式(I)的化合物的量表达：其中R₁为C_1‑24直链烷基；R₂为CH₂OH、CHO或COOH；R₃为H、OH或氧代(＝O)；且代表单键或双键，前提条件是R₃所连接的碳原子的化合价为四价，其中该MI‑FAE循环、MD‑FAE循环和该终止途径的所述酶中的每一种酶的底物独立地选自式(II)的化合物、丙二酰‑CoA、丙酰‑CoA或乙酰‑CoA：其中R₁为C_1‑24直链烷基；R₃为H、OH或氧代(＝O)；R₄为S‑CoA、ACP、OH或H；且代表单键或双键，前提条件是R₃所连接的碳原子的化合价为四价；其中该MI‑FAE循环的所述一种或多种酶各自对R₁上的碳原子数不大于所述式(I)化合物的R₁上的碳原子数的式(II)化合物具有选择性，其中该MD‑FAE循环的所述一种或多种酶各自对R₁上的碳原子数不大于所述式(I)化合物的R₁上的碳原子数的式(II)化合物具有选择性，和其中该终止途径的所述一种或多种酶各自对R₁上的碳原子数不小于所述式(I)化合物的R₁上的碳原子数的式(II)化合物具有选择性。