[发明专利]使用靶基因表达的线性组合评价细胞信号传导途径活性

摘要

本申请主要涉及至少基于在医学受试者的组织和/或细胞的提取样品中测量的细胞信号传导途径的一种或多种靶基因的表达水平，用于推断医学受试者的组织和/或细胞中的细胞信号传导途径的活性的具体方法，包含配置为执行此类方法的数字压缩机的仪器，和存储可通过数字处理装置执行此类方法的指令的非瞬时性存储介质。

主权项

一种方法，其包括：‑ 至少基于在医学受试者的组织和/或细胞的提取样品中测量的细胞信号传导途径的一种或多种靶基因的表达水平（20），推断医学受试者的组织和/或细胞中的细胞信号传导途径的活性，其中所述推断包括：测定在所述医学受试者的组织和/或细胞的提取样品中的转录因子（TF）元件水平（46），所述TF元件控制细胞信号传导途径的一种或多种靶基因的转录，所述测定至少部分基于评估将细胞信号传导途径的一种或多种靶基因的表达水平与TF元件的水平关联的数学模型（40‑1,...,40‑3），所述模型至少部分基于一种或多种靶基因的表达水平的一种或多种线性组合；和基于在所述医学受试者的组织和/或细胞的提取样品中测定的TF元件水平，推断所述医学受试者的组织和/或细胞中的细胞信号传导途径的活性；和‑ 基于所述医学受试者的组织和/或细胞中的细胞信号传导途径的推断活性，测定所述细胞信号传导途径在所述医学受试者的组织和/或细胞中是否异常运行；其中所述推断通过使用细胞信号传导途径的模型的数字处理装置（12）来执行。