[发明专利]一种获得寡核苷酸探针的方法有效

专利信息
申请号: 201410001939.X 申请日: 2014-01-02
公开(公告)号: CN103710455A 公开(公告)日: 2014-04-09
发明(设计)人: 唐宗祥;符书兰 申请(专利权)人: 四川农业大学
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12N15/10
代理公司: 北京众合诚成知识产权代理有限公司 11246 代理人: 龚燮英
地址: 611130 四*** 国省代码: 四川;51
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摘要: 发明公开了一种获得寡核苷酸探针的方法,该获得寡核苷酸探针的方法包括以下步骤:从NCBI网站中下载pSc119.2,pAs1,pTa-535,pTa71,pAWRC.1和CCS1的原始序列;用生物信息学软件DNAMAN,对下载的各序列进行分析,寻找这些序列中重复的核心单元,再回到NCBI网站中利用blastn工具进行比对,力争找到长度在60bp以下的核心寡核苷酸序列,以用作探针合成;将初步筛选出的众多寡核苷酸序列进行探针合成;待探针合成后,逐条进行FISH试验,验证探针的功能,验证合成的寡核苷酸序列是否能起到pSc119.2,pAs1,pTa-535,pTa71,pAWRC.1和CCS1的FISH效果;获得寡核苷酸探针。本发明省去了现有探针标记技术的繁琐过程,消除了探针标记失败的问题,降低了成本。
搜索关键词: 一种 获得 寡核苷酸 探针 方法
【主权项】:
一种获得寡核苷酸探针的方法,其特征在于,该获得寡核苷酸探针的方法包括以下步骤:步骤一,从NCBI网站中下载pSc119.2,pAs1,pTa‑535,pTa71,pAWRC.1和CCS1的原始序列;步骤二,用生物信息学软件DNAMAN,对下载的各序列进行分析,寻找这些序列中重复的核心单元,再回到NCBI网站中利用blastn工具进行比对,力争找到长度在60bp以下的核心寡核苷酸序列,以用作探针合成;步骤三,将初步筛选出的众多寡核苷酸序列进行探针合成;步骤四,待探针合成后,逐条进行FISH试验,验证探针的功能,验证合成的寡核苷酸序列是否能起到pSc119.2,pAs1,pTa‑535,pTa71,pAWRC.1和CCS1的FISH效果;获得寡核苷酸探针。
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