[发明专利]一种结核分枝杆菌四种一线药物耐药基因特异片段组合及其应用

摘要

本申请提供了结核病四种一线药物利福平、异烟肼、链霉素和乙胺丁醇的结核分枝杆菌耐药性检测相关的核酸片段组合及其应用。具体而言，本申请提供了利福平耐药相关基因rpoB，异烟肼耐药相关基因katG，inhA启动子和ahpC启动子，链霉素耐药相关基因rpsL和rrs，以及乙胺丁醇耐药相关基因embB的突变核酸片段组合、特异性检测突变的寡核苷酸、由此制备的试剂盒以及相关的耐药性检测方法。

主权项

用于结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis)耐药性检测的核酸片段组合，包括以下(1)至(7)：(1)SEQ ID NO:1的1276位至1356位的核酸序列的突变体，其中突变为：(1.1)：SEQ ID NO:1的第1289位的T突变为C，其导致SEQ ID NO:1所编码的氨基酸序列(SEQ ID NO:2)的第430位由Leu突变为Pro；(1.2)：SEQ ID NO:1的第1304位的A突变为G，其导致SEQ ID NO:1所编码的氨基酸序列(SEQ ID NO:2)的第435位由Asp突变为Gly；(1.3)：SEQ ID NO:1的第1303位的G突变为T，其导致SEQ ID NO:1所编码的氨基酸序列(SEQ ID NO:2)的第435位由Asp突变为Tyr；(1.4)：SEQ ID NO:1的第1333位的C突变为G，其导致SEQ ID NO:1所编码的氨基酸序列(SEQ ID NO:2)的第445位由His突变为Asp；(1.5)：SEQ ID NO:1的第1334位的A突变为G，其导致SEQ ID NO:1所编码的氨基酸序列(SEQ ID NO:2)的第445位由His突变为Arg；(1.6)：SEQ ID NO:1的第1333位的C突变为T，其导致SEQ ID NO:1所编码的氨基酸序列(SEQ ID NO:2)的第445位由His突变为Tyr；(1.7)：SEQ ID NO:1的第1349位的C突变为T，其导致SEQ ID NO:1所编码的氨基酸序列(SEQ ID NO:2)的第450位由Ser突变为Leu；(2)SEQ ID NO:3的748位至1281位的核酸序列的突变体，其中突变为：(2.1)：SEQ ID NO:3的第944位的G突变为C，其导致SEQ ID NO:3所编码的氨基酸序列(SEQ ID NO:4)的第315位由Ser突变为Thr；(2.2)：SEQ ID NO:3的第944位的G突变为A，其导致SEQ ID NO:3所编码的氨基酸序列(SEQ ID NO:4)的第315位由Ser突变为Asn；(3)SEQ ID NO:5的突变体，其中突变为第‑15位的C突变为T；(4)SEQ ID NO:6的突变体，其中突变为：(4.1)：SEQ ID NO:6的第‑46位的G突变为T；(4.2)：SEQ ID NO:6的第‑30位的C突变为T；(4.3)：SEQ ID NO:6的第‑10位的C突变为T；(5)SEQ ID NO:7的118位至270位的核酸序列的突变体，其中突变为：(5.1)：SEQ ID NO:7的第128位的A突变为G，其导致SEQ ID NO:7所编码的氨基酸序列(SEQ ID NO:8)的第43位由Lys突变为Arg；(5.2)：SEQ ID NO:7的第263位的A突变为G，其导致SEQ ID NO:7所编码的氨基酸序列(SEQ ID NO:8)的第88位由Lys突变为Arg；(6)SEQ ID NO:9的500位至530位的核酸序列的突变体，其中突变为：(6.1)：SEQ ID NO:9的第514位的A突变为C；(6.2)：SEQ ID NO:9的第517位的C突变为T；(7)SEQ ID NO:10的598位至1500位的核酸序列的突变体，其中突变为：(7.1)：SEQ ID NO:10的第916位的A突变为G，其导致SEQ ID NO:10所编码的氨基酸序列(SEQ ID NO:11)的第306位由Met突变为Val；(7.2)：SEQ ID NO:10的第918位的G突变为A，其导致SEQ ID NO:10所编码的氨基酸序列(SEQ ID NO:11)的第306位由Met突变为Ile；(7.3)：SEQ ID NO:10的第918位的G突变为C，其导致SEQ ID NO:10所编码的氨基酸序列(SEQ ID NO:11)的第306位由Met突变为Ile；(7.4)：SEQ ID NO:10的第918位的G突变为T，其导致SEQ ID NO:10所编码的氨基酸序列(SEQ ID NO:11)的第306位由Met突变为Ile；(7.5)：SEQ ID NO:10的第1217位的G突变为A，其导致SEQ ID NO:10所编码的氨基酸序列(SEQ ID NO:11)的第406位由Gly突变为Asp；(7.6)：SEQ ID NO:10的第1216位的G突变为A，其导致SEQ ID NO:10所编码的氨基酸序列(SEQ ID NO:11)的第406位由Gly突变为Ser。