[发明专利]一种稻瘟病抗性基因Pia的SNP分子标记及其方法与应用

摘要

本发明公开了一种稻瘟病抗性基因Pia的SNP分子标记，所述SNP位点位于水稻基因组11号染色体第6525745位核苷酸，该位点核苷酸由C突变为T，氨基酸由半胱氨酸（Cys）突变为酪氨酸（Tyr），由引物对SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2从水稻基因组DNA中扩增出来的核苷酸序列，经特异性酶切之后电泳检测，与稻瘟病抗性基因Pia呈特异性带型的分子标记。还公开了所述稻瘟病抗性基因Pia的SNP分子标记PiaSNP的检测方法及其应用，本发明的Pia功能特异性分子标记以PCR技术为基础，不仅能区分水稻品种的基因型，而且能够方便、快捷、直接地实现了目标基因Pia在水稻种质资源以及育种后代中的鉴定，特别是等位基因之间的鉴别，且不受环境以及人为因素的影响。

主权项

1.一种稻瘟病抗性基因Pia的SNP分子标记，其特征在于：所述SNP位点位于水稻基因组11号染色体第6525745位核苷酸(Chr11_6525745)，该分子标记位点核苷酸由C突变为T，氨基酸由半胱氨酸(Cys)突变为酪氨酸(Tyr)，该分子标记为由引物对SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2从水稻基因组DNA中扩增出来并能够被特异性酶切的核苷酸序列，即为确定稻瘟病抗性基因Pia的功能特异性分子标记PiaSNP；所述引物对的核苷酸序列如下所示：SEQ ID NO.1：5’‑GCTCCTTCTTCAATTACTGGGAATGGTCGA‑3’；SEQ ID NO.2：5’‑CTTGCAGTATCTCAAACTGG‑3’；所述的特异性酶切为Sal I酶切；所述水稻为福锦。