[发明专利]利用靶向扩增和测序的非侵入性胎儿基因组筛查

摘要

本发明提供了利用靶向扩增和测序的非侵入性胎儿基因组筛查的方法、系统和装置。选取了用于确定，例如，两个序列(或两组序列)的比率的失衡的一个或多个截止值。可以至少部分地基于含有母体核酸序列背景的诸如母体血浆的样品中胎儿DNA的百分比来确定所述截止值。还可以基于每一反应的序列的平均浓度来确定该截止值。在一方面，从估计含有特定核酸序列的信息孔的比例来确定该截止值，其中该比例基于上文所述的百分比和/或平均浓度来确定。可以利用诸如序贯概率比检验(SPRT)的许多不同类型的方法来确定该截止值。

主权项

通过分析母体血液样品确定胎儿非整倍性存在或缺失的方法，所述母体血液样品包括胎儿和母体的无细胞基因组DNA，所述方法包括：扩增来自第一染色体的第一特异性靶基因座的DNA和扩增来自至少一条第二染色体的第二特异性靶基因座的DNA；测序所述扩增的DNA以获得序列标签；确定来自所述第一染色体的第一特异性靶基因座的序列标签的第一量；确定来自所述至少一条第二染色体的第二特异性靶基因座的序列标签的第二量；以及比较序列标签的所述第一量和所述第二量，以确定所述第一染色体是否存在胎儿非整倍性。