[发明专利]病毒整合位点捕获测序分析方法有效
| 申请号： | 201410109470.1 | 申请日： | 2014-03-21 |
| 公开（公告）号： | CN103993069B | 公开（公告）日： | 2020-04-28 |
| 发明（设计）人： | 丘坤龙;何铭辉 | 申请（专利权）人： | 深圳华大基因科技服务有限公司 |
| 主分类号： | C12Q1/70 | 分类号： | C12Q1/70;C12Q1/6869;G16B30/10 |
| 代理公司： | 深圳市兴科达知识产权代理有限公司 44260 | 代理人： | 王翀 |
| 地址： | 518083 广东*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | 一种病毒整合位点捕获测序分析方法，该方法包括：将人的参考序列和病毒的参考序列合并在一起，构建一个混合参考序列；读取测序数据，过滤其中不合格的部分，得到过滤后的测序数据；利用比对软件将处理后的测序数据比对到混合参考序列上，获取一个比对结果，然后对该比对结果进行处理，得到一个用于检测病毒整合的比对结果；根据该用于检测病毒整合的比对结果，执行相应的操作，获取病毒整合的相关序列；综合上述相关序列的比对信息，获取病毒整合位点在参考序列上的坐标；综合整合位点的坐标信息，得到并输出病毒整合结果。利用本发明可以获得具有高精确度的病毒整合位点信息。 | ||
| 搜索关键词： | 病毒 整合 捕获 分析 方法 | ||
【主权项】：
一种病毒整合位点捕获测序分析方法，其特征在于，该方法包括：参考序列构建步骤，将人的参考序列和病毒的参考序列合并在一起，构建一个混合参考序列；数据过滤步骤，读取测序数据，过滤该测序数据中不合格的部分，得到过滤后的测序数据；数据比对步骤，利用比对软件将处理后的测序数据比对到混合参考序列上，获取一个比对结果，然后对该比对结果进行处理，得到一个用于检测病毒整合的比对结果；序列获取步骤，根据该用于检测病毒整合的比对结果，执行相应的操作，获取病毒整合的相关序列；整合位点获取步骤，综合上述相关序列的比对信息，获取病毒整合位点在混合参考序列上的坐标；及分析结果输出步骤，综合整合位点的坐标信息，得到并输出病毒整合结果。
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