[发明专利]一种快速鉴定和评价植物内参基因适用性的方法有效

专利信息
申请号: 201410138424.4 申请日: 2014-04-08
公开(公告)号: CN103882142A 公开(公告)日: 2014-06-25
发明(设计)人: 夏新莉;尹伟伦;王厚领 申请(专利权)人: 北京林业大学
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68
代理公司: 北京双收知识产权代理有限公司 11241 代理人: 卢新
地址: 100083 北京市海淀区清*** 国省代码: 北京;11
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摘要: 发明公开了一种快速鉴定和评价植物内参基因适用性的方法,包括如下步骤:(1)确定目标植物种类和目标基因,提取目标植物的总RNA,反转录为cDNA作为PCR的为模板,选择多个内参基因,设计特异性引物进行实时荧光定量PCR反应得到CT值;(2)将所述CT值数据通过geNorm、NormFinder、BestKeeper三种软件分析其适用性,用R软件的RankAggreg程序包,将每个处理里得到的四组适用性排序数据进行加权平均聚合,得到所述多个基因的最终适用性排序。本发明所述方法对于推动揭示植物生长发育、抗逆机理等基础性研究和培育速生、抗逆、丰产的植物新品种等应用型研究具有十分重要的意义。
搜索关键词: 一种 快速 鉴定 评价 植物 内参 基因 适用性 方法
【主权项】:
一种快速鉴定和评价植物内参基因适用性的方法,其特征在于:包括如下步骤:(1)确定目标植物种类和目标基因,并目标植物其进行前处理,提取目标植物的总RNA,反转录为cDNA作为PCR的为模板,选择多个在其它物种中常用的并在转录组中表达较稳定的多个内参基因,所述内参基因的数量大于等于9,设计特异性引物,进行实时荧光定量PCR反应,得到CT值;(2)将所述CT值数据通过geNorm、NormFinder、BestKeeper三种软件分析其适用性,然后用R软件的RankAggreg程序包,将每个处理里得到的四组适用性排序数据进行加权平均聚合,得到所述多个基因的最终适用性排序。
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