[发明专利]一种乙型肝炎病毒RNA定量PCR检测方法及试剂无效

专利信息
申请号: 201410215921.X 申请日: 2014-05-21
公开(公告)号: CN103981287A 公开(公告)日: 2014-08-13
发明(设计)人: 张伟;李艳红;张佳瑞;巩丽;朱少君;韩秀娟;姚丽;王姝妹 申请(专利权)人: 中国人民解放军第四军医大学
主分类号: C12Q1/70 分类号: C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/11;C12R1/93
代理公司: 西安通大专利代理有限责任公司 61200 代理人: 蔡和平
地址: 710032 *** 国省代码: 陕西;61
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摘要: 发明公开了一种乙型肝炎病毒RNA定量PCR检测方法及试剂,选取了与目的RNA cDNA大小相近的质粒作为竞争模板对基因拷贝数进行量化。选取不同的模板分别对fRNA和trRNA进行检测,具有通用性强、灵敏度高、特异性强、重复性好等优点,适于不同人群HBV RNA的检测,有望对HBV病毒各阶段的动力学进行更加全面的了解,完善传统检测项目。
搜索关键词: 一种 乙型肝炎 病毒 rna 定量 pcr 检测 方法 试剂
【主权项】:
一种乙型肝炎病毒RNA定量PCR检测方法,其特征在于,包括以下操作:1)第一轮扩增构建fRNA第一轮50ul RT/PCR反应体系:14.0μl H2O,10.0μl来自待检测对象的核酸提取物,1.0μl竞争模板19L27,1.5μl浓度为100ng/μl的引物1434+,3.0μl浓度为100ng/μl的引物1806a,3.0μl浓度为100ng/μl的引物1808a,5.0μl浓度为10mM的dNTP,2.5μl浓度为100mM的DTT溶液,10.0μl5×RT/PCR buffer,1.0μl RNA聚合酶;所述的引物1434+为:TCTCATCTGCCGGACCGTGT;所述的引物1806a为:(T)15AGCTC;所述的引物1808a为:(T)15GAAGC;构建trRNA第一轮50ulRT/PCR反应体系:17.0μl H2O,10.0μl来自待检测对象的核酸提取物,1.0μl竞争模板J166(16),1.5μl浓度为100ng/μl的引物1445+,3.0μl浓度为100ng/μl的引物1683a,5.0μl浓度为10mM的dNTP,2.5μl浓度为100mM的DTT溶液,10.0μl5×RT/PCR buffer,1.0μl RNA聚合酶;所述的引物1445+为:GGACCGTGGCACTTCGCTT;所述的引物1683a为:(T)15CGTGG;将构建的fRNA第一轮50ul RT/PCR反应体系、trRNA第一轮50ulRT/PCR反应体系分别按照以下RT/PCR程序进行半巢式扩增:50℃孵育20min;93℃变性1min40sec;DNA扩增为90℃40sec,53℃50sec,70℃40sec,35个循环;70℃15min后冷却至4℃;2)第二轮扩增构建fRNA第二轮反应体系:31.0μl H2O;5.0μl第一轮fRNA扩增产物,0.75μl浓度为100ng/μl的引物1464+,0.75μl浓度为100ng/μl的引物1806a‑(),0.75μl浓度为100ng/μl的引物1808a‑,5.0μl浓度为10mM的dNTP,1.5μl浓度为50mM的MgCl2溶液,5.0μl PCR buffer,0.25μl Taq DNA聚合酶;构建trRNA第二轮反应体系:31.75μl H2O,5.0μl第一轮trRNA扩增产物,0.75μl浓度为100ng/μl的引物1464+,0.75μl浓度为100ng/μl的引物1683a,5.0μl浓度为10mM的dNTP,1.5μl浓度为50mM的MgCl2溶液,5.0μl PCR buffer,0.25μl Taq DNA聚合酶;所述的引物1464+为:TCACCTCTGCACGTCGCATG;所述的引物1683a为:(T)15CGTGG;将构建的fRNA第二轮反应体系、trRNA第二轮反应体系分别按照以下RT/PCR程序进行半巢式扩增:93℃变性1min40sec;DNA扩增为90℃40sec,53℃50sec,70℃40sec,35个循环;70℃15min后冷却至4℃;3)琼脂糖凝胶电泳分离扩增产物在第二轮扩增完成之后,将扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳分离,同时添加一定浓度的竞争模板作为对照;比较扩增产物与竞争模板条带的信号值,如果两者信号值相当则表明待测对象中fRNA、trRNA的浓度与竞争模板的浓度相当;如果两者的信号值不相当,则增加或稀释琼脂糖凝胶电泳时竞争模板的浓度,直到两者信号值相当为至。
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