[发明专利]高杂合基因组的组装方法

摘要

本发明公开了一种高杂合基因组的组装方法。该组装方法包括根据待测物种的体细胞基因组序列信息构建德布鲁因图的步骤和简化德布鲁因图的步骤，简化德布鲁因图的步骤包括以下步骤：对待测物种的生殖细胞的单细胞基因组进行测序；比对体细胞基因组的序列信息与生殖细胞的单细胞基因组的序列信息，找到体细胞基因组序列中的杂合位点的序列信息；以及根据杂合位点的序列信息，简化德布鲁因图。本发明的组装方法通过利用生殖细胞单细胞的基因组序列信息找出高杂合基因组中的杂合位点，并在简化德布鲁因图的时候进行辅助组装，解决了现有技术在组装拼接中的杂合位点难以简化的问题，从而实现高杂合基因组的拼接组装。

主权项

一种高杂合基因组的组装方法，所述组装方法包括根据待测物种的体细胞基因组序列信息构建德布鲁因图的步骤、简化所述德布鲁因图以及根据简化后的所述德布鲁因图，拼接得到高杂合基因组的组装序列的步骤，其特征在于，简化所述德布鲁因图的步骤包括以下步骤：对待测物种的生殖细胞的单细胞基因组进行测序；比对所述体细胞基因组的序列信息与所述生殖细胞的单细胞基因组的序列信息，找到所述体细胞基因组序列中的杂合位点的序列信息；以及根据所述杂合位点的序列信息，简化所述德布鲁因图；所述高杂合基因组是指杂合度高达1％以上的基因组。