[发明专利]一种甲基化DNA高通量测序接头和引物设计方法在审
申请号: | 201410376283.X | 申请日: | 2014-08-03 |
公开(公告)号: | CN105316315A | 公开(公告)日: | 2016-02-10 |
发明(设计)人: | 严冰冰;孔祥生;邹晓文;吴海芳 | 申请(专利权)人: | 晶能生物技术(上海)有限公司 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 201111 上海市闵*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | 本发明属于分子生物学技术领域,具体涉及的一种甲基化DNA高通量测序接头和引物设计方法。其特征在于针对切位点是否含酶,不同非连接端突出结构类型以及不同连接端类型,设计不同的接头和引物,解决MeDIP与亚硫酸盐翻转导致序列改变之间的矛盾,能够在不影响MeDIP的情况下,经亚硫酸盐之后成功扩增DNA片段库并能进行后续的常规建库。 | ||
搜索关键词: | 一种 甲基化 dna 通量 接头 引物 设计 方法 | ||
【主权项】:
一种甲基化DNA高通量测序接头和引物设计方法,其特征在于,辅助接头为下述a‑h中的至少一种:a为不含酶切位点,非连接端为一条链突出结构,连接端为粘末端;b为含酶切位点,非连接端为一条链突出结构,连接端为粘末端;c为不含酶切位点,非连接端为树杈结构,连接端为粘末端;d为含酶切位点,非连接端为树杈结构,连接端为粘末端;e为不含酶切位点,非连接端为一条链突出结构,连接端为平末端;f为含酶切位点,非连接端为一条链突出结构,连接端为平末端;g为不含酶切位点,非连接端为树杈结构,连接端为平末端;h为含酶切位点,非连接端为树杈结构,连接端为平末端;
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